13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2110 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  100 
 
 
481 aa  991    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  91.46 
 
 
480 aa  889    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  63.42 
 
 
480 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  63.91 
 
 
460 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  59.95 
 
 
486 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  54.66 
 
 
470 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  56.47 
 
 
450 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  52.71 
 
 
458 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  55.06 
 
 
471 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  45.22 
 
 
636 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  21.65 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  25.79 
 
 
472 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.2 
 
 
14944 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>