19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3394 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  70.7 
 
 
458 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  100 
 
 
470 aa  960    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  78.49 
 
 
471 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  55.79 
 
 
480 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  56.48 
 
 
486 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  59.91 
 
 
460 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  57.81 
 
 
480 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  57.18 
 
 
481 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  55.71 
 
 
450 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  44.61 
 
 
636 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.7 
 
 
913 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  23.13 
 
 
469 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.48 
 
 
911 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  27.12 
 
 
835 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  22.69 
 
 
424 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  22.29 
 
 
459 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  23.31 
 
 
675 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  32.48 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  29.29 
 
 
583 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>