32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0173 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  942    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  32.85 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  34.52 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  29.72 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  29.6 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  27.84 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  26.3 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  26.72 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  26.13 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  26.13 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  25.87 
 
 		 416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  25.45 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  25.45 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  25.45 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  25.72 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7661  hypothetical protein  26.22 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  22.47 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1477  hypothetical protein  26.14 
 
 		 605 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5196  hypothetical protein  28.19 
 
 		 645 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0675413  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9106  hypothetical protein  27.51 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  22.51 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  21.65 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  23.21 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  21.19 
 
 		 460 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  22.29 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  23.23 
 
 		 4231 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  33.04 
 
 		 450 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  25.47 
 
 		 14944 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  31 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  24.84 
 
 		 636 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  26.47 
 
 		 583 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>