21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2062 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  100 
 
 		 373 aa  769    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  40.11 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  37.87 
 
 		 446 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  37.28 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  38.27 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  36.79 
 
 		 416 aa  255  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  39.11 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  37.04 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  38.67 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  37.53 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  37.53 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  37.53 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  32.6 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  29.57 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  26.72 
 
 		 459 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  25.56 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  23.44 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  27.48 
 
 		 583 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.52 
 
 		 2096 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  24.44 
 
 		 466 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1477  hypothetical protein  20.27 
 
 		 605 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>