25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3068 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  100 
 
 		 472 aa  931    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  50.88 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  43.12 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  25.4 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  35.29 
 
 		 583 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  25.49 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  24.91 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  24.54 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  24.91 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  24.14 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  24.61 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  23.43 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  24.9 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  24.72 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  25.79 
 
 		 481 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  23.42 
 
 		 416 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  24.9 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  23.41 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  22.17 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1611  LVIVD repeat-containing protein  33.78 
 
 		 568 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.83 
 
 		 2096 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  26.14 
 
 		 713 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  25.86 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  23.2 
 
 		 4231 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>