19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2512 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  100 
 
 
518 aa  1032    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  49.03 
 
 
472 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  42.8 
 
 
466 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  23.44 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  33.33 
 
 
583 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  23.45 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  22.71 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  25.07 
 
 
405 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  23.02 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  26.29 
 
 
450 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  23.32 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  22.28 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  23.32 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  21.33 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  24.62 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  23.32 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  24.23 
 
 
416 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  24.84 
 
 
14609 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  25.56 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>