24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1282 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  82.45 
 
 
415 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  92.55 
 
 
416 aa  796    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  89.54 
 
 
417 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  89.78 
 
 
417 aa  772    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  93.27 
 
 
416 aa  803    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  850    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  89.78 
 
 
417 aa  772    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  85.02 
 
 
446 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  97.12 
 
 
416 aa  832    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  67.39 
 
 
417 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  36.79 
 
 
373 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  39.51 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  30.2 
 
 
476 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  29.06 
 
 
428 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  25.87 
 
 
459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1477  hypothetical protein  25.69 
 
 
605 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7661  hypothetical protein  25.79 
 
 
602 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523321  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5196  hypothetical protein  23.11 
 
 
645 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0675413  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.42 
 
 
2096 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  23.97 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9106  hypothetical protein  23.26 
 
 
594 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  24.43 
 
 
645 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  24.23 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  21.48 
 
 
583 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>