29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6317 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  980    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  41.15 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  32.85 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  31.73 
 
 		 416 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  31.51 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  30.85 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  30.2 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  30.28 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  29.32 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  29.96 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  29.96 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  29.74 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  29.67 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  28.61 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  29.57 
 
 		 373 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5196  hypothetical protein  27.78 
 
 		 645 aa  67  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0675413  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7661  hypothetical protein  28.09 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1477  hypothetical protein  25.91 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  24.91 
 
 		 583 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.32 
 
 		 2096 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  21.93 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9106  hypothetical protein  27.17 
 
 		 594 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  32.14 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  23.45 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  32.48 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  24.92 
 
 		 14944 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  23.94 
 
 		 4231 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  27.22 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  21.38 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>