13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0316 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  100 
 
 		 466 aa  922    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  41.37 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  44.86 
 
 		 518 aa  289  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  26.63 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  26.05 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 4231 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  28.89 
 
 		 583 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  22.07 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.86 
 
 		 2096 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  23.64 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  22.73 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  22.73 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  22.73 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>