30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4367 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  100 
 
 
583 aa  1197    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  27.48 
 
 
373 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  35.29 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  26.47 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  24.17 
 
 
428 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  23.35 
 
 
446 aa  58.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  33.33 
 
 
518 aa  57  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  24.91 
 
 
476 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  24.23 
 
 
415 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  22.99 
 
 
416 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  22.27 
 
 
417 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  22.27 
 
 
417 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  22.27 
 
 
417 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  25.13 
 
 
4231 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  27.97 
 
 
466 aa  50.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  33.33 
 
 
2096 aa  50.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  22.22 
 
 
416 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.28 
 
 
911 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  29.08 
 
 
417 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  30.68 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  26.17 
 
 
645 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 
913 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  26.47 
 
 
459 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  28.81 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  31.78 
 
 
538 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  30.16 
 
 
882 aa  44.3  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  29.29 
 
 
470 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  26.57 
 
 
416 aa  43.9  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  22.27 
 
 
416 aa  43.9  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  26.09 
 
 
486 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>