41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0788 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  100 
 
 		 645 aa  1302    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.84 
 
 		 2096 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.39 
 
 		 4231 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  29.75 
 
 		 882 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1948  hypothetical protein  27.5 
 
 		 713 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.92 
 
 		 11716 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  23.57 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  23.16 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5493  hypothetical protein  22.6 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.35 
 
 		 12684 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0082  LVIVD repeat protein  23.97 
 
 		 256 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0043  LVIVD repeat-containing protein  22.6 
 
 		 796 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  22.9 
 
 		 14944 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3663  LVIVD repeat protein  22.56 
 
 		 385 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022114  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  24.92 
 
 		 424 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.79 
 
 		 658 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  26.98 
 
 		 14609 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  24.28 
 
 		 1295 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00705  hypothetical protein  22.34 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  22.62 
 
 		 501 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  29.63 
 
 		 1432 aa  48.9  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  24.39 
 
 		 416 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  24.59 
 
 		 417 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  24.59 
 
 		 417 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0387  LVIVD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 603 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1657 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  20.52 
 
 		 417 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  34.78 
 
 		 450 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  21.38 
 
 		 1344 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  26.17 
 
 		 583 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  24.47 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1232  LVIVD repeat protein  22.39 
 
 		 717 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  24.43 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.21 
 
 		 828 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  24.47 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.34 
 
 		 865 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  23.47 
 
 		 675 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.77 
 
 		 757 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1344 aa  44.3  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.78 
 
 		 5216 aa  43.9  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>