18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1477 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5196  hypothetical protein  82.82 
 
 		 645 aa  988    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0675413  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1477  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1240    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7661  hypothetical protein  87.11 
 
 		 602 aa  1013    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9106  hypothetical protein  44.3 
 
 		 594 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  24.75 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  26.14 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  25.69 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  25.69 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  26.19 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  26.19 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  26.19 
 
 		 417 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  25.79 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  25.3 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  25.18 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  24.9 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  24.3 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  25.91 
 
 		 476 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2062  LVIVD repeat protein  22.52 
 
 		 373 aa  44.3  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>