18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0046 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  100 
 
 
636 aa  1284    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  46.52 
 
 
480 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  47.09 
 
 
458 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  44.61 
 
 
470 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  45.22 
 
 
481 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  43.33 
 
 
486 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  45.6 
 
 
460 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  45.14 
 
 
450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  45.64 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  45.01 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  28.32 
 
 
538 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  26.17 
 
 
501 aa  55.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.44 
 
 
913 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  27.12 
 
 
835 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  23.76 
 
 
675 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  28.32 
 
 
424 aa  47.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  24.84 
 
 
459 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.55 
 
 
911 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>