18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9106 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9106  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1226    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1477  hypothetical protein  45.49 
 
 
605 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5196  hypothetical protein  44.1 
 
 
645 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0675413  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7661  hypothetical protein  44.5 
 
 
602 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523321  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2303  hypothetical protein  26.49 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  27.72 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  20.74 
 
 
446 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2458  hypothetical protein  21.96 
 
 
417 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2369  hypothetical protein  21.75 
 
 
415 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963325  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2557  hypothetical protein  21.43 
 
 
417 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3049  hypothetical protein  21.15 
 
 
416 aa  64.3  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3028  hypothetical protein  21.69 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  0.016195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1282  hypothetical protein  23.64 
 
 
416 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2877  hypothetical protein  22.04 
 
 
416 aa  60.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  24.43 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1192  hypothetical protein  24.3 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  27.17 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  22.52 
 
 
405 aa  43.9  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>