297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4721 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  100 
 
 		 617 aa  1259    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  65.32 
 
 		 614 aa  793    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  54.94 
 
 		 538 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  55.56 
 
 		 539 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  40.06 
 
 		 365 aa  218  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  41.6 
 
 		 314 aa  187  4e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  36.4 
 
 		 275 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  36 
 
 		 275 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  36 
 
 		 275 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  35.6 
 
 		 275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  34.25 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  35.2 
 
 		 275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  36.4 
 
 		 256 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  34.65 
 
 		 539 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.23 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  33.6 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  35.97 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.32 
 
 		 1266 aa  104  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  33.86 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  33.93 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.99 
 
 		 1075 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  31.13 
 
 		 267 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  32.69 
 
 		 558 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  32.31 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  37.13 
 
 		 1310 aa  97.8  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  28.16 
 
 		 466 aa  97.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  36.94 
 
 		 272 aa  95.1  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  38.82 
 
 		 1503 aa  94.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 762 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  38.71 
 
 		 982 aa  94.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  30.34 
 
 		 596 aa  94  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.46 
 
 		 870 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.71 
 
 		 870 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.82 
 
 		 876 aa  91.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.26 
 
 		 942 aa  91.3  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  36.16 
 
 		 780 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.42 
 
 		 870 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.42 
 
 		 870 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.42 
 
 		 870 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.42 
 
 		 873 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  30.87 
 
 		 341 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  36.09 
 
 		 780 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 		 1010 aa  87  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  35.4 
 
 		 311 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.71 
 
 		 885 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  37.65 
 
 		 948 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  37.28 
 
 		 1346 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  34.78 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  28.04 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  37.82 
 
 		 871 aa  84  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 		 818 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.54 
 
 		 870 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.88 
 
 		 870 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.93 
 
 		 1092 aa  84.3  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.54 
 
 		 870 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 		 818 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  37.95 
 
 		 948 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  37.35 
 
 		 948 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  36.94 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  33.74 
 
 		 516 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.26 
 
 		 945 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.82 
 
 		 1091 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.76 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.58 
 
 		 892 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  45.92 
 
 		 651 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.94 
 
 		 944 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  34.12 
 
 		 948 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  48.91 
 
 		 854 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  33.97 
 
 		 865 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.76 
 
 		 894 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.06 
 
 		 2334 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  30.21 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  37.42 
 
 		 984 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  34.94 
 
 		 944 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  43.09 
 
 		 674 aa  77  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.48 
 
 		 703 aa  77  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.33 
 
 		 848 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  34.34 
 
 		 944 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  34.34 
 
 		 944 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 		 1121 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  46.15 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  35.54 
 
 		 944 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.18 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  48.84 
 
 		 768 aa  74.3  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  50.6 
 
 		 973 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  45.16 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  46.46 
 
 		 608 aa  73.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.66 
 
 		 729 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  46.15 
 
 		 674 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  39.84 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  39.84 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  39.84 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  39.84 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  39.56 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  40.18 
 
 		 1154 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  39.84 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  44.09 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  31.74 
 
 		 655 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 2170 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  33.88 
 
 		 890 aa  71.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>