84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2661 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  100 
 
 		 308 aa  642    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  70.68 
 
 		 311 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  35.37 
 
 		 538 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  34.51 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  35.57 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  33.94 
 
 		 539 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  34.16 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  34.78 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32.08 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  31.11 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  29.77 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.13 
 
 		 1346 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  29.49 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.91 
 
 		 1310 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  30.05 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  28.35 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  28.57 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  29.75 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  30.13 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  32.05 
 
 		 1503 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  28.57 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  32.5 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  29.41 
 
 		 542 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  31.93 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  32.58 
 
 		 553 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  32.14 
 
 		 539 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  30.28 
 
 		 558 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  30.28 
 
 		 558 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  31.97 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  31.15 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  30.08 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  33.33 
 
 		 657 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  29.14 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  27.32 
 
 		 442 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  31.2 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  26.92 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  27.64 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  27.39 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  28.57 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  28.1 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  27.64 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  29.51 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  29.51 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  28.46 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  30.25 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  35.71 
 
 		 516 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  29.27 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  26.49 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  26.49 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  29.46 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  25.81 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  25.81 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  25.81 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  28.68 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  29.41 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  25.83 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  33.78 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  26.97 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  28.1 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  28.1 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  27.39 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  28.45 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  25.83 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  27.5 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  25.17 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  27.69 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  27.5 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1165  EndA/NucM family protease / nuclease  40 
 
 		 103 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.55589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  28.33 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>