221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2634 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  100 
 
 		 1310 aa  2680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  48.64 
 
 		 1346 aa  1227    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.91 
 
 		 826 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.67 
 
 		 1075 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  43.58 
 
 		 780 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  44.34 
 
 		 1503 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  44.6 
 
 		 948 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  43.71 
 
 		 780 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  43.96 
 
 		 948 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  43.92 
 
 		 944 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  43.85 
 
 		 948 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.83 
 
 		 955 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.73 
 
 		 945 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  43.92 
 
 		 944 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.68 
 
 		 944 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  43.37 
 
 		 948 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  43.37 
 
 		 944 aa  559  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.14 
 
 		 942 aa  559  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  43.53 
 
 		 944 aa  559  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.72 
 
 		 818 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.88 
 
 		 818 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.68 
 
 		 947 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.17 
 
 		 940 aa  548  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.5 
 
 		 848 aa  545  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  44.83 
 
 		 624 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  44.83 
 
 		 624 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  44.83 
 
 		 624 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.83 
 
 		 624 aa  459  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.83 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.83 
 
 		 624 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.41 
 
 		 2346 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.86 
 
 		 603 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.62 
 
 		 604 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  47.58 
 
 		 514 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 604 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 604 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.83 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.78 
 
 		 600 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.83 
 
 		 604 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  44.87 
 
 		 622 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.21 
 
 		 621 aa  432  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.33 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.21 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.8 
 
 		 1052 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.16 
 
 		 620 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.97 
 
 		 1148 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.64 
 
 		 1641 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.5 
 
 		 1641 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.22 
 
 		 627 aa  423  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.53 
 
 		 1148 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 		 653 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.13 
 
 		 1266 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.1 
 
 		 942 aa  386  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.33 
 
 		 641 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.96 
 
 		 601 aa  382  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.29 
 
 		 1284 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.57 
 
 		 573 aa  364  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.95 
 
 		 871 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  38.31 
 
 		 795 aa  356  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.27 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.28 
 
 		 876 aa  348  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.56 
 
 		 870 aa  348  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.32 
 
 		 870 aa  347  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.09 
 
 		 870 aa  347  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.64 
 
 		 870 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.09 
 
 		 870 aa  344  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.09 
 
 		 870 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  33.45 
 
 		 865 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.09 
 
 		 870 aa  341  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 870 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  33.57 
 
 		 869 aa  339  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  33.81 
 
 		 871 aa  335  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.06 
 
 		 894 aa  334  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.14 
 
 		 873 aa  331  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 		 885 aa  330  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 		 892 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.22 
 
 		 2667 aa  326  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.4 
 
 		 2796 aa  318  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  32.66 
 
 		 984 aa  316  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  32.18 
 
 		 890 aa  311  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.8 
 
 		 1123 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  32.47 
 
 		 982 aa  308  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.3 
 
 		 2775 aa  307  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  32.33 
 
 		 863 aa  287  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  34.9 
 
 		 945 aa  278  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 1010 aa  276  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.78 
 
 		 481 aa  271  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  54.47 
 
 		 542 aa  265  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  51.63 
 
 		 539 aa  264  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  52.85 
 
 		 553 aa  263  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  53.94 
 
 		 558 aa  262  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  53.94 
 
 		 558 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  34.1 
 
 		 572 aa  259  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.56 
 
 		 1525 aa  256  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.03 
 
 		 575 aa  255  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  33.43 
 
 		 1512 aa  248  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.91 
 
 		 570 aa  249  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 929 aa  244  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.99 
 
 		 554 aa  244  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>