More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1534 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.44 
 
 		 944 aa  1627    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  92.09 
 
 		 948 aa  1758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  86.29 
 
 		 944 aa  1642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.45 
 
 		 826 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  96.84 
 
 		 948 aa  1855    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.84 
 
 		 947 aa  1210    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  86.6 
 
 		 944 aa  1650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.88 
 
 		 945 aa  1231    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  50.97 
 
 		 780 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  87.13 
 
 		 944 aa  1660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.95 
 
 		 1075 aa  693    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  51.48 
 
 		 780 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.84 
 
 		 942 aa  1279    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.86 
 
 		 940 aa  1316    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  86.6 
 
 		 944 aa  1667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 948 aa  1937    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  98 
 
 		 948 aa  1866    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.12 
 
 		 955 aa  1204    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  43.96 
 
 		 1310 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.12 
 
 		 848 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.25 
 
 		 818 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  44.92 
 
 		 1503 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44 
 
 		 818 aa  532  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  40.79 
 
 		 1346 aa  499  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.77 
 
 		 2346 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.3 
 
 		 1052 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.83 
 
 		 1148 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.11 
 
 		 1641 aa  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.53 
 
 		 1148 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.53 
 
 		 1641 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.06 
 
 		 624 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  46.06 
 
 		 624 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.06 
 
 		 624 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  46.06 
 
 		 624 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  46.06 
 
 		 624 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.06 
 
 		 624 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.3 
 
 		 942 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.59 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.13 
 
 		 641 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.24 
 
 		 603 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.7 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  45.7 
 
 		 622 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.17 
 
 		 600 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.96 
 
 		 604 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.96 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.33 
 
 		 627 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.26 
 
 		 870 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.17 
 
 		 621 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.55 
 
 		 599 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.03 
 
 		 870 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  47.17 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.55 
 
 		 620 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.38 
 
 		 620 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.22 
 
 		 870 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.03 
 
 		 870 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 		 871 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.29 
 
 		 1266 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.35 
 
 		 653 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.41 
 
 		 870 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.3 
 
 		 892 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 870 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  33.45 
 
 		 865 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.22 
 
 		 870 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.06 
 
 		 876 aa  365  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.1 
 
 		 870 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.82 
 
 		 573 aa  360  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 		 894 aa  360  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  32.71 
 
 		 871 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 		 885 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  32.7 
 
 		 890 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  40.17 
 
 		 795 aa  353  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.17 
 
 		 1284 aa  350  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 873 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  32.79 
 
 		 982 aa  338  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  34.33 
 
 		 984 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  32.84 
 
 		 869 aa  331  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  33.02 
 
 		 863 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.07 
 
 		 2796 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.61 
 
 		 1010 aa  309  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.09 
 
 		 2667 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.31 
 
 		 1123 aa  270  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.94 
 
 		 2775 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  32.81 
 
 		 1652 aa  266  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.75 
 
 		 868 aa  264  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.55 
 
 		 570 aa  257  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  32.7 
 
 		 945 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.17 
 
 		 575 aa  251  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.95 
 
 		 1577 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  36.56 
 
 		 572 aa  244  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.34 
 
 		 481 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 		 929 aa  238  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.72 
 
 		 902 aa  232  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 		 554 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  33.6 
 
 		 1591 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  31.5 
 
 		 1577 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  32.38 
 
 		 1512 aa  218  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>