203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01224 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  49.19 
 
 		 1310 aa  1251    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  100 
 
 		 1346 aa  2732    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.95 
 
 		 955 aa  572  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.71 
 
 		 826 aa  562  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  42.6 
 
 		 1503 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  41.61 
 
 		 948 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.21 
 
 		 942 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.38 
 
 		 940 aa  526  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  42.02 
 
 		 944 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  41.49 
 
 		 948 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  41.22 
 
 		 948 aa  523  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  41.88 
 
 		 944 aa  523  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  41.95 
 
 		 944 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 		 947 aa  513  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  41 
 
 		 944 aa  513  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.82 
 
 		 945 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.82 
 
 		 944 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  40.59 
 
 		 948 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.26 
 
 		 1075 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.85 
 
 		 818 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.55 
 
 		 848 aa  482  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  40.36 
 
 		 780 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  40.28 
 
 		 780 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.25 
 
 		 818 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  43.46 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  43.46 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  43.46 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.46 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.46 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.46 
 
 		 624 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.67 
 
 		 2346 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.31 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.31 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.13 
 
 		 604 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  42.76 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.86 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.46 
 
 		 621 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.61 
 
 		 604 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.96 
 
 		 604 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.61 
 
 		 604 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.89 
 
 		 1641 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.93 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  44.24 
 
 		 514 aa  383  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.68 
 
 		 1641 aa  383  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  41.29 
 
 		 795 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.12 
 
 		 1052 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 		 1148 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.11 
 
 		 1148 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.59 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.51 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.94 
 
 		 627 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.77 
 
 		 599 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.7 
 
 		 620 aa  362  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 		 871 aa  361  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.31 
 
 		 873 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 		 1266 aa  358  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.52 
 
 		 620 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.03 
 
 		 573 aa  354  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.87 
 
 		 641 aa  352  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 		 870 aa  350  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.36 
 
 		 870 aa  350  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  33.65 
 
 		 871 aa  348  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.52 
 
 		 870 aa  348  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 		 870 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 		 870 aa  343  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 		 870 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  33.53 
 
 		 865 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.38 
 
 		 942 aa  340  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 		 870 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 		 870 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.83 
 
 		 885 aa  336  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  33.29 
 
 		 984 aa  332  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 		 876 aa  332  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 869 aa  332  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  32.46 
 
 		 982 aa  331  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.04 
 
 		 1284 aa  330  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.96 
 
 		 892 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 		 894 aa  318  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.33 
 
 		 586 aa  317  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  33.45 
 
 		 863 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.54 
 
 		 2667 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.66 
 
 		 2796 aa  299  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  31.09 
 
 		 890 aa  296  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.93 
 
 		 2775 aa  287  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.64 
 
 		 1123 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  34.6 
 
 		 945 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 		 1010 aa  276  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  54.25 
 
 		 553 aa  263  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  52.44 
 
 		 539 aa  260  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 		 929 aa  259  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  54.55 
 
 		 558 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  52.02 
 
 		 542 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  54.13 
 
 		 558 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 		 868 aa  253  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.41 
 
 		 902 aa  249  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  53.74 
 
 		 388 aa  246  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  34.97 
 
 		 572 aa  243  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 		 575 aa  242  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  32.74 
 
 		 1506 aa  240  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  30.47 
 
 		 1591 aa  235  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>