147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3396 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  69.14 
 
 
542 aa  775    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  65.59 
 
 
558 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  75.9 
 
 
553 aa  832    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  65.41 
 
 
558 aa  752    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  100 
 
 
539 aa  1101    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  51.82 
 
 
1310 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  52.63 
 
 
1346 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  56.28 
 
 
388 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  54.71 
 
 
1503 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  55.6 
 
 
275 aa  243  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  55.17 
 
 
275 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  55.6 
 
 
275 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  55.6 
 
 
275 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  54.74 
 
 
275 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  52.79 
 
 
256 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  50.87 
 
 
267 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  46.72 
 
 
378 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  38.89 
 
 
285 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  38.58 
 
 
466 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  36.7 
 
 
596 aa  146  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  36.47 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.65 
 
 
807 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.17 
 
 
818 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.39 
 
 
807 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.61 
 
 
802 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  33.73 
 
 
657 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  35.43 
 
 
538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.69 
 
 
823 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.4 
 
 
819 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.29 
 
 
819 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.29 
 
 
819 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.29 
 
 
819 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
803 aa  113  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.41 
 
 
805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.41 
 
 
805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.41 
 
 
809 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  50.77 
 
 
658 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  35 
 
 
539 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.42 
 
 
365 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  50.83 
 
 
803 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.51 
 
 
579 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  46.72 
 
 
807 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  34.65 
 
 
617 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  52.25 
 
 
789 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  50.98 
 
 
553 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.67 
 
 
494 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  36.02 
 
 
272 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  48.76 
 
 
489 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32.93 
 
 
614 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.99 
 
 
630 aa  100  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  46.6 
 
 
775 aa  98.6  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  48 
 
 
789 aa  96.7  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  46.08 
 
 
778 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  46.08 
 
 
778 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  42.15 
 
 
534 aa  95.1  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.67 
 
 
629 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  46.15 
 
 
794 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
629 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.07 
 
 
520 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.33 
 
 
629 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  46.08 
 
 
778 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  45.1 
 
 
778 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.67 
 
 
629 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  46.08 
 
 
535 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  42.31 
 
 
823 aa  90.9  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.47 
 
 
628 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  48.98 
 
 
609 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  41.58 
 
 
777 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  42.39 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  32.99 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  36.67 
 
 
560 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  35.48 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  42 
 
 
701 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  48.68 
 
 
774 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.34 
 
 
501 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  30.57 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  34.82 
 
 
677 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  39.58 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  34.94 
 
 
314 aa  72.8  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  36.27 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  44.94 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  32.14 
 
 
219 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  34.88 
 
 
323 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  32.85 
 
 
321 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  32.81 
 
 
321 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  32.81 
 
 
321 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  36.36 
 
 
852 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  31.06 
 
 
211 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  31.85 
 
 
311 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  37.69 
 
 
229 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  36.92 
 
 
229 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 
523 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02674  protease  36.08 
 
 
176 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  36.64 
 
 
243 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  31.58 
 
 
233 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  30.83 
 
 
235 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  28.57 
 
 
232 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  29.32 
 
 
232 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  29.32 
 
 
235 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  29.32 
 
 
235 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>