66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02448 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  100 
 
 		 482 aa  1006    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  51.98 
 
 		 476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  42.27 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  38.84 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.83 
 
 		 802 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  35.92 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.35 
 
 		 818 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.86 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  40 
 
 		 658 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  44.94 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  40.23 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  38.04 
 
 		 789 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.37 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  44.94 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  35.92 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  47.06 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  40 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.25 
 
 		 805 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.74 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.64 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.25 
 
 		 805 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  34.34 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  40 
 
 		 789 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  34.74 
 
 		 778 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  33.94 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.51 
 
 		 819 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  33.94 
 
 		 558 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  33.68 
 
 		 778 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.27 
 
 		 819 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.27 
 
 		 819 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  38.55 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.33 
 
 		 628 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.27 
 
 		 819 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.51 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  34.74 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  25.23 
 
 		 1204 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  32.63 
 
 		 778 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  32.63 
 
 		 778 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  41.56 
 
 		 794 aa  64.3  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.67 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.96 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.96 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  37.5 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.96 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.96 
 
 		 629 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  45.07 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  32.08 
 
 		 701 aa  60.1  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  30.1 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.5 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.79 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  27.91 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  34.09 
 
 		 823 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  30.84 
 
 		 677 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  25.31 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  43.33 
 
 		 774 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  27.81 
 
 		 741 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  29.73 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  23.71 
 
 		 338 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  29.89 
 
 		 631 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  26.27 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.93 
 
 		 721 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  31.03 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  28.24 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>