More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0557 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  65.21 
 
 		 778 aa  1024    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  64.96 
 
 		 778 aa  1024    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  65.21 
 
 		 778 aa  1025    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  100 
 
 		 774 aa  1595    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  62.64 
 
 		 775 aa  964    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  49.48 
 
 		 780 aa  726    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  65.08 
 
 		 778 aa  1022    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  65.04 
 
 		 777 aa  1039    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  50.57 
 
 		 609 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  46.75 
 
 		 701 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  55.91 
 
 		 759 aa  512  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  55.31 
 
 		 791 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  52.4 
 
 		 485 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  51.66 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  51.68 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  50.2 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  50.2 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  50.1 
 
 		 500 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  49.59 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  39.39 
 
 		 673 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  38.29 
 
 		 543 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  38.11 
 
 		 543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  36.35 
 
 		 558 aa  290  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  38.62 
 
 		 558 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  48.75 
 
 		 677 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  47.08 
 
 		 823 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1626  hypothetical protein  32.58 
 
 		 557 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2906  hypothetical protein  31.94 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3049  hypothetical protein  31.94 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1620  hypothetical protein  33.2 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  31.58 
 
 		 565 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  31.76 
 
 		 532 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  31.25 
 
 		 546 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  30.42 
 
 		 566 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  31.26 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  30.16 
 
 		 566 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  30.16 
 
 		 566 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  30.46 
 
 		 566 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  30 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  30 
 
 		 566 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.02 
 
 		 566 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.02 
 
 		 566 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  29.8 
 
 		 566 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  29.52 
 
 		 566 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  43.75 
 
 		 807 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  28.53 
 
 		 721 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.99 
 
 		 819 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.99 
 
 		 819 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.99 
 
 		 819 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.99 
 
 		 819 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.98 
 
 		 809 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.98 
 
 		 805 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.98 
 
 		 805 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.61 
 
 		 803 aa  122  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 		 823 aa  120  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.97 
 
 		 807 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.54 
 
 		 818 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56 
 
 		 807 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.12 
 
 		 802 aa  118  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  28.6 
 
 		 924 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  27.45 
 
 		 556 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  51.75 
 
 		 553 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  30.71 
 
 		 556 aa  114  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.56 
 
 		 494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  54.08 
 
 		 789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  52.53 
 
 		 803 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.56 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  28.84 
 
 		 556 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  28.07 
 
 		 554 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  28.07 
 
 		 549 aa  108  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  36.45 
 
 		 658 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.85 
 
 		 629 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  42.76 
 
 		 221 aa  107  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.85 
 
 		 629 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  28.54 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 		 629 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 		 629 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  32.92 
 
 		 1154 aa  105  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  41.45 
 
 		 351 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  27.49 
 
 		 556 aa  104  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  27.44 
 
 		 554 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  27.29 
 
 		 552 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  42.14 
 
 		 353 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  27.29 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  39.74 
 
 		 789 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  35.55 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  41.26 
 
 		 794 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.71 
 
 		 835 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  27.54 
 
 		 591 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  26.51 
 
 		 549 aa  101  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  33.7 
 
 		 351 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  27.44 
 
 		 591 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.68 
 
 		 836 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  25.63 
 
 		 478 aa  99.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  27.16 
 
 		 591 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  34.43 
 
 		 1251 aa  99.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  27.2 
 
 		 1031 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  38.27 
 
 		 347 aa  98.2  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  31.58 
 
 		 509 aa  98.2  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  31.58 
 
 		 509 aa  98.2  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>