145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2515 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  100 
 
 
500 aa  1035    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  96.8 
 
 
500 aa  962    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  91.6 
 
 
500 aa  934    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  68.46 
 
 
485 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  67.4 
 
 
499 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  52.03 
 
 
775 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  52.2 
 
 
498 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  52.2 
 
 
498 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  49.71 
 
 
774 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  49.8 
 
 
777 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  48.5 
 
 
780 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  49.22 
 
 
778 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  48.54 
 
 
778 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  48.54 
 
 
778 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  48.54 
 
 
778 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  50.73 
 
 
759 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  50.85 
 
 
609 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  47.27 
 
 
701 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  46.08 
 
 
791 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  42.35 
 
 
673 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  43.67 
 
 
543 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  43.67 
 
 
543 aa  300  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  40.48 
 
 
558 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  40.24 
 
 
558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2906  hypothetical protein  31 
 
 
553 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3049  hypothetical protein  31.37 
 
 
553 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1626  hypothetical protein  30.66 
 
 
557 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1620  hypothetical protein  31.06 
 
 
557 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  31.76 
 
 
546 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  34.07 
 
 
527 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  30.83 
 
 
532 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  36.01 
 
 
565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  31.35 
 
 
566 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  31.35 
 
 
566 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  31.35 
 
 
566 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  29.04 
 
 
721 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  31.73 
 
 
566 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  31.47 
 
 
566 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  31.73 
 
 
566 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  31.47 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  31.2 
 
 
566 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.56 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.56 
 
 
566 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  34.69 
 
 
556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  30.86 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  42.05 
 
 
221 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  41.45 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  28.01 
 
 
924 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  30.86 
 
 
556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  30.24 
 
 
556 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  36.06 
 
 
1031 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.2 
 
 
1154 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  36.94 
 
 
353 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  28 
 
 
360 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  32.14 
 
 
375 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  34.88 
 
 
351 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  34.02 
 
 
347 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  33.51 
 
 
348 aa  96.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  32.46 
 
 
403 aa  96.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  32.47 
 
 
347 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  25.78 
 
 
984 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  33.51 
 
 
341 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  35.15 
 
 
347 aa  93.6  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  37.43 
 
 
274 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  36.84 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  29.64 
 
 
507 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  26.72 
 
 
567 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  35.54 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  26.72 
 
 
567 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  26.72 
 
 
567 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  26.72 
 
 
567 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  31.96 
 
 
342 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  28.12 
 
 
509 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  28.12 
 
 
509 aa  90.5  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  35.62 
 
 
349 aa  90.1  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  34.42 
 
 
1251 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  31.38 
 
 
565 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  25.9 
 
 
567 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  26.11 
 
 
567 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  32.27 
 
 
1250 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  26.51 
 
 
568 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  25.69 
 
 
567 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  31.94 
 
 
354 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  25.69 
 
 
567 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  26.72 
 
 
567 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  26.21 
 
 
893 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  29.65 
 
 
565 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  29.65 
 
 
565 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  29.63 
 
 
356 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  26.88 
 
 
565 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  26.88 
 
 
565 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  34.62 
 
 
549 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  34.62 
 
 
554 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  33.75 
 
 
357 aa  87.4  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  29.86 
 
 
565 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  29.36 
 
 
565 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  26.67 
 
 
565 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  27.27 
 
 
591 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  34.07 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  27.05 
 
 
549 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>