145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1623 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  100 
 
 
375 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  75.35 
 
 
353 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  60.22 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  54.34 
 
 
347 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  55.14 
 
 
350 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  54.24 
 
 
360 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  53.47 
 
 
347 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  54.62 
 
 
342 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  56.56 
 
 
348 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  54.31 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  52.05 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  52.29 
 
 
356 aa  352  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  50.29 
 
 
349 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  54.05 
 
 
351 aa  346  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  54.39 
 
 
403 aa  345  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  48.56 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  55.71 
 
 
547 aa  320  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  46.52 
 
 
356 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  46.43 
 
 
356 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  50.17 
 
 
430 aa  275  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  61.11 
 
 
207 aa  252  9.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  38.29 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  42.16 
 
 
565 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  44.44 
 
 
566 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  44.44 
 
 
566 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  44.44 
 
 
566 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  40.07 
 
 
546 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  43.65 
 
 
566 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  43.25 
 
 
566 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  44.44 
 
 
566 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  44.44 
 
 
566 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  43.25 
 
 
566 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  41.03 
 
 
556 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  41.64 
 
 
532 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  42.86 
 
 
566 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  40.29 
 
 
556 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  39.11 
 
 
554 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  39.62 
 
 
556 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  42.86 
 
 
566 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  39.11 
 
 
549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  42.97 
 
 
556 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  39.25 
 
 
554 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  39.03 
 
 
552 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  39.03 
 
 
547 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  38.87 
 
 
591 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  38.75 
 
 
591 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  38.75 
 
 
591 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  42.97 
 
 
556 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  38.87 
 
 
549 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  38.01 
 
 
478 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  43.22 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  39.84 
 
 
509 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  39.84 
 
 
509 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  37.65 
 
 
507 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  39 
 
 
1017 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  35.55 
 
 
1031 aa  133  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  32.54 
 
 
1154 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  32.64 
 
 
984 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  33.08 
 
 
527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  35.34 
 
 
673 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  37.04 
 
 
791 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  39.39 
 
 
780 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  37.38 
 
 
777 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  36.24 
 
 
701 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  37.31 
 
 
759 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  35.38 
 
 
775 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  32.47 
 
 
500 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  42.24 
 
 
499 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  33.33 
 
 
485 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  36.6 
 
 
221 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  32.79 
 
 
500 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  30.32 
 
 
924 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  32.86 
 
 
500 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  35.55 
 
 
774 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  35.15 
 
 
543 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  35.15 
 
 
543 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  28.77 
 
 
565 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  39.88 
 
 
778 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  39.88 
 
 
778 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  39.88 
 
 
778 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  39.88 
 
 
778 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  33.18 
 
 
609 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  36.08 
 
 
498 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  36.08 
 
 
498 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  28.12 
 
 
567 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  28.88 
 
 
565 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  28.12 
 
 
567 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.12 
 
 
567 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.12 
 
 
567 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  28.12 
 
 
567 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  28.12 
 
 
567 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  28.78 
 
 
565 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  28.12 
 
 
567 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  28.07 
 
 
565 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  28.12 
 
 
567 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1233  propeptide, peptidase M4 and M36  27.37 
 
 
565 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6599  propeptide, peptidase M4 and M36  27.37 
 
 
565 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6203  peptidase M4 thermolysin  27.37 
 
 
565 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231867  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  27.78 
 
 
567 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2762  neutral protease  28.12 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000113293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>