More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0115 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  100 
 
 		 823 aa  1689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  45.28 
 
 		 868 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  46.49 
 
 		 777 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  46.13 
 
 		 778 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  45.76 
 
 		 778 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  45.76 
 
 		 778 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  45.76 
 
 		 778 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  47.41 
 
 		 677 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  44.28 
 
 		 775 aa  227  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  47.08 
 
 		 774 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.6 
 
 		 836 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.6 
 
 		 835 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.47 
 
 		 835 aa  147  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  49.1 
 
 		 818 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.85 
 
 		 835 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  33.84 
 
 		 780 aa  138  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  41.72 
 
 		 840 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  26.09 
 
 		 940 aa  123  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.64 
 
 		 638 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  29.17 
 
 		 488 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  28.89 
 
 		 483 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  46.61 
 
 		 807 aa  111  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  36.93 
 
 		 1151 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.66 
 
 		 823 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  28.12 
 
 		 643 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  31.82 
 
 		 465 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.48 
 
 		 579 aa  104  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.08 
 
 		 805 aa  104  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.08 
 
 		 809 aa  104  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.37 
 
 		 807 aa  104  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.08 
 
 		 805 aa  104  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.97 
 
 		 534 aa  104  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 819 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 819 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 819 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 819 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.61 
 
 		 802 aa  103  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  44 
 
 		 803 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  40 
 
 		 967 aa  99.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  46.3 
 
 		 553 aa  99.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.76 
 
 		 818 aa  99.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  45.3 
 
 		 658 aa  98.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  30.51 
 
 		 434 aa  98.2  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  53.26 
 
 		 792 aa  97.8  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  30.3 
 
 		 575 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.63 
 
 		 629 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.63 
 
 		 629 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.78 
 
 		 494 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.63 
 
 		 629 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  50 
 
 		 789 aa  95.9  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  49.46 
 
 		 965 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  42.72 
 
 		 553 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  49.46 
 
 		 965 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  30.69 
 
 		 462 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.44 
 
 		 1565 aa  95.5  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  47.47 
 
 		 965 aa  95.5  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  46.94 
 
 		 701 aa  95.5  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  47.31 
 
 		 965 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  30.92 
 
 		 462 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.27 
 
 		 1158 aa  95.1  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.35 
 
 		 807 aa  94.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.69 
 
 		 629 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  35.9 
 
 		 852 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  47.31 
 
 		 965 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  48.35 
 
 		 965 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  43.75 
 
 		 713 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  45 
 
 		 789 aa  92  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.19 
 
 		 803 aa  92  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.1 
 
 		 942 aa  92  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.35 
 
 		 630 aa  91.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  52.5 
 
 		 965 aa  91.3  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  52.5 
 
 		 965 aa  91.3  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  32.86 
 
 		 1057 aa  91.3  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  52.5 
 
 		 965 aa  91.3  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  47.31 
 
 		 965 aa  90.9  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  41.44 
 
 		 971 aa  90.9  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  38.24 
 
 		 489 aa  90.1  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  42.72 
 
 		 539 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  47.13 
 
 		 971 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  47.13 
 
 		 971 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 628 aa  88.6  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  40.78 
 
 		 542 aa  89  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  45.98 
 
 		 971 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  45.98 
 
 		 971 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.39 
 
 		 693 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  40.94 
 
 		 948 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  45.98 
 
 		 971 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  45.98 
 
 		 971 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  45.98 
 
 		 1018 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.37 
 
 		 944 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  45.98 
 
 		 971 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.87 
 
 		 1732 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  37.41 
 
 		 944 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.05 
 
 		 3295 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  44.83 
 
 		 971 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.76 
 
 		 940 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  36.69 
 
 		 944 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  36.69 
 
 		 944 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  34.21 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  31.36 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>