248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1408 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  100 
 
 
721 aa  1491    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  28.74 
 
 
498 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  29.94 
 
 
780 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  31.21 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  30.36 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  29.73 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  28.16 
 
 
498 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  29.26 
 
 
609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  27.88 
 
 
500 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  30.35 
 
 
701 aa  129  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  28.53 
 
 
774 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  27.76 
 
 
777 aa  127  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  29.04 
 
 
778 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  28.71 
 
 
500 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  29.04 
 
 
778 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  29.04 
 
 
778 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  29.04 
 
 
778 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  28.62 
 
 
775 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  27.32 
 
 
759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  26.53 
 
 
673 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  27.19 
 
 
791 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  26.42 
 
 
543 aa  90.9  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  26.42 
 
 
543 aa  90.5  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  28.88 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  28.45 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  39.47 
 
 
840 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  33.55 
 
 
1311 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1626  hypothetical protein  23.94 
 
 
557 aa  61.6  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  49.12 
 
 
918 aa  61.6  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.67 
 
 
2122 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  31.2 
 
 
1027 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.25 
 
 
1094 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  42.19 
 
 
960 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  26.6 
 
 
532 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  53.19 
 
 
951 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  41.54 
 
 
960 aa  57.4  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  41.54 
 
 
960 aa  57.4  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  28.8 
 
 
349 aa  57.4  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.05 
 
 
941 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  32.04 
 
 
965 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  45.1 
 
 
818 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.39 
 
 
838 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  33.7 
 
 
451 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.644592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  36.11 
 
 
859 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.71 
 
 
971 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  44.62 
 
 
1667 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  33.67 
 
 
963 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  38.67 
 
 
1380 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.18 
 
 
1842 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  39.19 
 
 
978 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.84 
 
 
951 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1620  hypothetical protein  23.55 
 
 
557 aa  55.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  41.38 
 
 
869 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  41.94 
 
 
938 aa  55.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  35.44 
 
 
2036 aa  55.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  36.84 
 
 
1151 aa  55.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  40.62 
 
 
865 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.07 
 
 
965 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  31.07 
 
 
965 aa  54.7  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  40.38 
 
 
967 aa  54.7  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.85 
 
 
929 aa  54.7  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 
836 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  31.32 
 
 
527 aa  54.3  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11488  serine protease, subtilase family protein  38.16 
 
 
312 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  40.32 
 
 
943 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  52.08 
 
 
1162 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 
1732 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  51.16 
 
 
871 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  35.16 
 
 
1095 aa  53.9  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  31.63 
 
 
1231 aa  53.9  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  39.06 
 
 
871 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.96 
 
 
1528 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  51.16 
 
 
867 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 
1158 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  42.42 
 
 
1282 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  39.44 
 
 
1969 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  32.14 
 
 
861 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.35 
 
 
835 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  36.05 
 
 
1862 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  37.7 
 
 
965 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  42.59 
 
 
669 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
823 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.51 
 
 
1361 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  26.88 
 
 
528 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.35 
 
 
835 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.88 
 
 
735 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  29.13 
 
 
965 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.29 
 
 
679 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.65 
 
 
845 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  27.93 
 
 
965 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.72 
 
 
1620 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 
3295 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  29.13 
 
 
965 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.23 
 
 
2554 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  49.12 
 
 
870 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  39.29 
 
 
713 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  37.1 
 
 
1882 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  35.14 
 
 
1120 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  30.63 
 
 
575 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  30.08 
 
 
347 aa  51.6  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>