298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0421 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  100 
 
 
501 aa  1047    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  47.31 
 
 
504 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  45.85 
 
 
677 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  43.06 
 
 
523 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  45.7 
 
 
417 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  44.06 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  44.5 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  43.81 
 
 
417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  47.28 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  47.28 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  45.24 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  44.42 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  43.92 
 
 
408 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  43.92 
 
 
408 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  44.59 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  44.59 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  44.59 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  44.59 
 
 
384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  37.38 
 
 
483 aa  240  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  32.56 
 
 
397 aa  181  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  37.46 
 
 
401 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  36.43 
 
 
401 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  31.99 
 
 
397 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  31.99 
 
 
402 aa  161  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  35.03 
 
 
407 aa  160  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  32.11 
 
 
390 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1158  hypothetical protein  30.54 
 
 
398 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1163  hypothetical protein  29.17 
 
 
398 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.61 
 
 
628 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.6 
 
 
629 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.6 
 
 
629 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.6 
 
 
629 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.6 
 
 
629 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  48.54 
 
 
807 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.54 
 
 
823 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.54 
 
 
805 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.54 
 
 
809 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.54 
 
 
805 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  45.37 
 
 
609 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.6 
 
 
819 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.6 
 
 
819 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.6 
 
 
819 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.6 
 
 
819 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  44.44 
 
 
489 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  42.2 
 
 
534 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  42.11 
 
 
658 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  45.83 
 
 
553 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.54 
 
 
803 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.16 
 
 
807 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43 
 
 
807 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.99 
 
 
630 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  44.44 
 
 
775 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.57 
 
 
494 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  43.56 
 
 
803 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43 
 
 
818 aa  93.6  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  44.9 
 
 
777 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.24 
 
 
802 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  43.16 
 
 
778 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  42.11 
 
 
778 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  43.16 
 
 
778 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  43.16 
 
 
778 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  46.07 
 
 
533 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  40.78 
 
 
789 aa  90.1  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  42.16 
 
 
774 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  40.4 
 
 
535 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  43.88 
 
 
789 aa  87.8  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  41.18 
 
 
794 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.98 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  28.83 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  36.94 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  36.94 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.27 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  32.84 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  29 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  26.3 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.76 
 
 
579 aa  76.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  26.95 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  26.72 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  31.67 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  38.95 
 
 
539 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  36.63 
 
 
553 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  30.29 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  34.45 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  32.17 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  32.56 
 
 
472 aa  72  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  28.05 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.84 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  37.62 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  26.64 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.11 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  34.13 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.03 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  26.44 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  37.62 
 
 
469 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  25.11 
 
 
458 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  36.63 
 
 
468 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.31 
 
 
557 aa  67  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.57 
 
 
334 aa  67  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  35.34 
 
 
476 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  35.2 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>