122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0360 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 1091 aa  2165    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  87.55 
 
 		 1092 aa  1888    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.11 
 
 		 1075 aa  211  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.54 
 
 		 1266 aa  163  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.92 
 
 		 826 aa  162  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.84 
 
 		 940 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 945 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.95 
 
 		 955 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  48.24 
 
 		 780 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.03 
 
 		 947 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  45.29 
 
 		 780 aa  145  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 818 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 818 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  47.09 
 
 		 948 aa  141  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.74 
 
 		 944 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.38 
 
 		 470 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  46.6 
 
 		 948 aa  139  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  46.2 
 
 		 944 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  48.77 
 
 		 948 aa  137  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.36 
 
 		 942 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  45.65 
 
 		 944 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  45.65 
 
 		 944 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  45.65 
 
 		 944 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 		 948 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.33 
 
 		 848 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  36.28 
 
 		 1310 aa  114  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 940 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.11 
 
 		 1795 aa  109  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 810 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 		 1073 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1076 aa  105  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.77 
 
 		 870 aa  98.6  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  35.75 
 
 		 614 aa  95.1  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  39.16 
 
 		 1346 aa  92  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.67 
 
 		 885 aa  91.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  25.21 
 
 		 600 aa  87.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 		 871 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.24 
 
 		 592 aa  87.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  35.18 
 
 		 865 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.07 
 
 		 802 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  39.2 
 
 		 617 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 870 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.26 
 
 		 876 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.51 
 
 		 873 aa  82  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 		 870 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  38.92 
 
 		 869 aa  81.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 		 892 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 		 870 aa  79  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.05 
 
 		 870 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.91 
 
 		 870 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.91 
 
 		 870 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  34.57 
 
 		 871 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.77 
 
 		 821 aa  76.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 		 894 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  36.07 
 
 		 982 aa  75.5  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  41.59 
 
 		 2305 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  42.48 
 
 		 2310 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  24.71 
 
 		 802 aa  73.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.55 
 
 		 586 aa  71.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  23.32 
 
 		 984 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  32.28 
 
 		 890 aa  70.1  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 		 1012 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.27 
 
 		 1037 aa  68.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.09 
 
 		 2194 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 		 1118 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.87 
 
 		 1052 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.86 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1222 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.18 
 
 		 1340 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.09 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.93 
 
 		 928 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.09 
 
 		 1113 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.15 
 
 		 1052 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.87 
 
 		 2796 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 1710 aa  63.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.03 
 
 		 1225 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.82 
 
 		 891 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.86 
 
 		 1009 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.98 
 
 		 1010 aa  62.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.04 
 
 		 1800 aa  62.4  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.03 
 
 		 1269 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.03 
 
 		 1269 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.98 
 
 		 1284 aa  58.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 		 601 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.05 
 
 		 788 aa  55.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 		 2346 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.6 
 
 		 790 aa  53.5  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.99 
 
 		 788 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  33.33 
 
 		 5899 aa  52  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.12 
 
 		 1641 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 		 1148 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  22.39 
 
 		 788 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 620 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 599 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 620 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.45 
 
 		 2775 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.17 
 
 		 1661 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>