73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1618 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  100 
 
 		 1710 aa  3418    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.26 
 
 		 1949 aa  573  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.76 
 
 		 2254 aa  569  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 377 aa  332  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0365  phosphotransferase domain-containing protein  33.12 
 
 		 776 aa  210  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0985561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0319  phosphotransferase domain-containing protein  29.5 
 
 		 546 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.888377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0337  phosphotransferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 546 aa  191  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  30.07 
 
 		 742 aa  172  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  30.85 
 
 		 1855 aa  150  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  25.36 
 
 		 333 aa  97.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  25.07 
 
 		 333 aa  96.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 		 1266 aa  88.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  25.64 
 
 		 780 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.07 
 
 		 945 aa  75.9  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  23.86 
 
 		 780 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 1075 aa  74.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2748  hypothetical protein  25.86 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.19 
 
 		 947 aa  72  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.35 
 
 		 470 aa  71.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 		 1092 aa  70.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.11 
 
 		 955 aa  62.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 848 aa  62.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  29.24 
 
 		 614 aa  62  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.85 
 
 		 818 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  28.57 
 
 		 1310 aa  60.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.85 
 
 		 818 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 1091 aa  60.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0316  hypothetical protein  34.95 
 
 		 449 aa  60.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 		 892 aa  60.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  30.77 
 
 		 948 aa  59.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  36.29 
 
 		 948 aa  59.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 		 942 aa  58.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  34.68 
 
 		 948 aa  57.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4510  hypothetical protein  35 
 
 		 441 aa  57.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15739  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  34.68 
 
 		 948 aa  57.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  37.29 
 
 		 944 aa  56.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  37.29 
 
 		 944 aa  56.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  37.29 
 
 		 944 aa  56.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1008  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.09 
 
 		 519 aa  56.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  25.51 
 
 		 871 aa  56.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.59 
 
 		 944 aa  56.2  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 		 940 aa  55.5  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  28.41 
 
 		 1346 aa  54.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  28.92 
 
 		 1084 aa  53.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 		 873 aa  53.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.45 
 
 		 876 aa  52  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 		 870 aa  51.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  35.59 
 
 		 944 aa  51.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.5 
 
 		 826 aa  51.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  29.08 
 
 		 869 aa  50.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 870 aa  50.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 		 894 aa  51.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.06 
 
 		 870 aa  50.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0708  hypothetical protein  21.54 
 
 		 646 aa  50.4  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.13 
 
 		 1010 aa  50.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0496  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.92 
 
 		 765 aa  50.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  24.12 
 
 		 617 aa  50.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.45 
 
 		 870 aa  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  32.63 
 
 		 3586 aa  49.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 		 870 aa  49.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.5 
 
 		 885 aa  48.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.06 
 
 		 870 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  34.88 
 
 		 2350 aa  47.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0888  hypothetical protein  35.94 
 
 		 359 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  50 
 
 		 614 aa  47.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.75 
 
 		 870 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.69 
 
 		 1876 aa  46.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  37.36 
 
 		 642 aa  45.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.56 
 
 		 740 aa  45.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1123  hypothetical protein  22.9 
 
 		 786 aa  45.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3140  hypothetical protein  24.44 
 
 		 301 aa  45.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  31.36 
 
 		 982 aa  45.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  37.78 
 
 		 650 aa  45.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>