27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1008 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1008  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 519 aa  1030    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4611  hypothetical protein  31.79 
 
 		 515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000359693  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0724  hypothetical protein  31.79 
 
 		 515 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0583  hypothetical protein  30.92 
 
 		 517 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0761  hypothetical protein  31.46 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0658  hypothetical protein  31.46 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000101222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0602  hypothetical protein  31.46 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0747  hypothetical protein  31.13 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000294502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0692  hypothetical protein  31.46 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0603  hypothetical protein  31.13 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000260984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0820  hypothetical protein  31.13 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0607  hypothetical protein  30.59 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000138147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  32.12 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0135  hypothetical protein  28.77 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.396927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0130  hypothetical protein  28.77 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2287  hypothetical protein  29.76 
 
 		 516 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000434113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0779  Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier  26.77 
 
 		 760 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0496  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.08 
 
 		 2254 aa  60.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0614  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.96 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.673121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1060  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.99 
 
 		 213 aa  57  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.86 
 
 		 1949 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 1710 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3140  hypothetical protein  33.58 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 		 1015 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2553  hypothetical protein  24.17 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0244  hypothetical protein  31.76 
 
 		 254 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000208552  hitchhiker  0.000000653556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>