19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2287 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0130  hypothetical protein  62.82 
 
 
514 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2287  hypothetical protein  100 
 
 
516 aa  1065    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000434113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0135  hypothetical protein  62.82 
 
 
514 aa  669    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.396927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0583  hypothetical protein  50 
 
 
517 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0761  hypothetical protein  47.36 
 
 
515 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0607  hypothetical protein  47.64 
 
 
515 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000138147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0724  hypothetical protein  47.83 
 
 
515 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4611  hypothetical protein  47.83 
 
 
515 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000359693  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0747  hypothetical protein  47.49 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000294502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0658  hypothetical protein  47.49 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000101222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0602  hypothetical protein  47.49 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0603  hypothetical protein  47.3 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000260984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0692  hypothetical protein  47.49 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0820  hypothetical protein  47.97 
 
 
515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0779  Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier  40.87 
 
 
760 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1008  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.76 
 
 
519 aa  97.8  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  34.09 
 
 
504 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3140  hypothetical protein  21.63 
 
 
301 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0957  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>