34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6937 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  100 
 
 		 504 aa  1003    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  64.71 
 
 		 710 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  62.03 
 
 		 788 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  64.1 
 
 		 753 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  60.76 
 
 		 884 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  60.84 
 
 		 918 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  56.79 
 
 		 586 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  56.47 
 
 		 1243 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  59.39 
 
 		 691 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  51.22 
 
 		 663 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1008  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.12 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.96 
 
 		 651 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0607  hypothetical protein  27.84 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000138147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.64 
 
 		 583 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0602  hypothetical protein  27.49 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0724  hypothetical protein  27.24 
 
 		 515 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0761  hypothetical protein  27.19 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0820  hypothetical protein  27.19 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0658  hypothetical protein  27.19 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000101222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4611  hypothetical protein  27.24 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000359693  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0603  hypothetical protein  27.19 
 
 		 515 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000260984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0692  hypothetical protein  27.19 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0747  hypothetical protein  27.19 
 
 		 515 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000294502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  40.62 
 
 		 641 aa  92.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0583  hypothetical protein  27.1 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  38 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0130  hypothetical protein  24.12 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0135  hypothetical protein  24.12 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.396927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.02 
 
 		 474 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0779  Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier  28.98 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.79 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2287  hypothetical protein  27.53 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000434113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1555  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.6 
 
 		 612 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1617  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.6 
 
 		 606 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0588913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>