202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7497 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
1243 aa  2488    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  79.85 
 
 
691 aa  396  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  30.44 
 
 
906 aa  393  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  69.23 
 
 
586 aa  343  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  29.79 
 
 
1270 aa  340  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 
1144 aa  211  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.34 
 
 
878 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.11 
 
 
962 aa  186  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  57.86 
 
 
504 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  42.91 
 
 
753 aa  170  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.82 
 
 
984 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  47.67 
 
 
788 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  41.22 
 
 
884 aa  161  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  50.62 
 
 
710 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  45.85 
 
 
918 aa  151  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  46.75 
 
 
663 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.6 
 
 
971 aa  121  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.22 
 
 
1362 aa  118  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  68.75 
 
 
592 aa  117  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  50.43 
 
 
1147 aa  105  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  35.11 
 
 
802 aa  101  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  56.3 
 
 
1131 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 
734 aa  97.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.26 
 
 
596 aa  97.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  42.68 
 
 
641 aa  97.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.29 
 
 
651 aa  95.1  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  55.45 
 
 
601 aa  94  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.76 
 
 
467 aa  92  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  23.75 
 
 
875 aa  91.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  61.11 
 
 
580 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.03 
 
 
817 aa  89  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  60.2 
 
 
1077 aa  86.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  25.32 
 
 
823 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  48.37 
 
 
597 aa  84.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  27.27 
 
 
840 aa  84  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.09 
 
 
818 aa  84  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.44 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.77 
 
 
583 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
1049 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.63 
 
 
835 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 
474 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.73 
 
 
837 aa  77.4  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.15 
 
 
750 aa  77.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.18 
 
 
1171 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  26.08 
 
 
1015 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 
1043 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  37.76 
 
 
727 aa  76.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  20.78 
 
 
864 aa  75.5  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  21.69 
 
 
837 aa  74.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.69 
 
 
813 aa  74.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
888 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.27 
 
 
744 aa  73.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.75 
 
 
913 aa  73.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  36.5 
 
 
586 aa  73.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  31.34 
 
 
717 aa  73.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.92 
 
 
845 aa  72.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  21.66 
 
 
831 aa  70.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.17 
 
 
1063 aa  71.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
1079 aa  70.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.21 
 
 
624 aa  70.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  21.55 
 
 
724 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  24.81 
 
 
824 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  32.94 
 
 
813 aa  70.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.84 
 
 
1781 aa  69.7  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 
781 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.62 
 
 
781 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.91 
 
 
1033 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.93 
 
 
928 aa  68.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.18 
 
 
811 aa  68.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.56 
 
 
922 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.23 
 
 
972 aa  68.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.85 
 
 
862 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 
766 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  22.74 
 
 
897 aa  68.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.2 
 
 
986 aa  68.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  23.56 
 
 
763 aa  67.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  25.07 
 
 
738 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  22.99 
 
 
897 aa  65.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.03 
 
 
813 aa  66.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  24.49 
 
 
880 aa  65.5  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  23.92 
 
 
824 aa  65.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.48 
 
 
704 aa  65.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  22.5 
 
 
1112 aa  64.3  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 
871 aa  64.3  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  22.06 
 
 
812 aa  64.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.68 
 
 
889 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  21.54 
 
 
793 aa  63.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25 
 
 
785 aa  63.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.66 
 
 
743 aa  63.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 
739 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  25.18 
 
 
829 aa  62.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 
984 aa  62.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.47 
 
 
824 aa  61.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.8 
 
 
805 aa  61.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.45 
 
 
805 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  24.27 
 
 
815 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.37 
 
 
845 aa  61.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
1094 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
873 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.92 
 
 
1033 aa  60.1  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>