162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0146 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  48.17 
 
 
829 aa  762    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  49.58 
 
 
824 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  50.3 
 
 
840 aa  795    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
817 aa  1687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  49.75 
 
 
799 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  44.9 
 
 
843 aa  662    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  46.27 
 
 
846 aa  735    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  49.27 
 
 
812 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  87.15 
 
 
818 aa  1503    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  43.76 
 
 
843 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  47.2 
 
 
831 aa  730    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  42.52 
 
 
880 aa  656    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  39.06 
 
 
813 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.5 
 
 
845 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  32.8 
 
 
864 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  38.79 
 
 
819 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 
786 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  39.56 
 
 
833 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.32 
 
 
845 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.11 
 
 
813 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 
785 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  32.98 
 
 
875 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  37.95 
 
 
839 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  34.02 
 
 
793 aa  399  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  34.89 
 
 
823 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  30.98 
 
 
860 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.89 
 
 
835 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 
897 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.28 
 
 
842 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.73 
 
 
872 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  34.62 
 
 
837 aa  376  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  32.13 
 
 
863 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  30.78 
 
 
871 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  34.54 
 
 
847 aa  343  5e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  33.08 
 
 
815 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  32.88 
 
 
861 aa  340  5.9999999999999996e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  33.94 
 
 
819 aa  340  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  33.74 
 
 
819 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  29.73 
 
 
802 aa  337  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  31.94 
 
 
802 aa  332  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  29.72 
 
 
891 aa  330  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 
891 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.93 
 
 
837 aa  323  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  31.29 
 
 
824 aa  317  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  33.81 
 
 
838 aa  315  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.57 
 
 
940 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  27.34 
 
 
845 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 
663 aa  210  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 
763 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.17 
 
 
826 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.7 
 
 
826 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  26.03 
 
 
882 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.76 
 
 
882 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  25 
 
 
820 aa  153  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.3 
 
 
878 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  26.71 
 
 
839 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  26.71 
 
 
839 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  26.71 
 
 
839 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  26.71 
 
 
839 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  26.71 
 
 
839 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  26.71 
 
 
839 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  26.71 
 
 
839 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  28.06 
 
 
811 aa  142  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  28.79 
 
 
816 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  27.04 
 
 
962 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  27.61 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 
734 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 
816 aa  137  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.92 
 
 
744 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  27.81 
 
 
828 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  27.81 
 
 
828 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  27.81 
 
 
828 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  22.89 
 
 
821 aa  132  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 
853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  27.47 
 
 
825 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
1144 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  25.92 
 
 
827 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  24.11 
 
 
856 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  26.13 
 
 
812 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.7 
 
 
971 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.06 
 
 
984 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.03 
 
 
1243 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.25 
 
 
815 aa  86.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 
724 aa  85.5  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
739 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.01 
 
 
720 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.44 
 
 
901 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.13 
 
 
757 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.88 
 
 
858 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  20.76 
 
 
803 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 
906 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.18 
 
 
623 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.14 
 
 
1362 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.28 
 
 
609 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.05 
 
 
799 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  28.01 
 
 
648 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.93 
 
 
609 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.67 
 
 
619 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.5 
 
 
640 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.84 
 
 
575 aa  62.4  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>