187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4671 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  55.35 
 
 
845 aa  929    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 
845 aa  1732    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  38.71 
 
 
815 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  37.03 
 
 
819 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  38.62 
 
 
819 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  39.03 
 
 
824 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  36.56 
 
 
863 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 
871 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  36.11 
 
 
802 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  35.69 
 
 
864 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  38.59 
 
 
840 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  32.71 
 
 
813 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.76 
 
 
842 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  34.24 
 
 
802 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  35.71 
 
 
819 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  35.43 
 
 
860 aa  485  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  35.37 
 
 
875 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  33.92 
 
 
891 aa  469  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 
891 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.39 
 
 
813 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  38.18 
 
 
812 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  33.29 
 
 
837 aa  442  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.83 
 
 
835 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  33.33 
 
 
823 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.62 
 
 
872 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  34.28 
 
 
861 aa  436  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  40.9 
 
 
799 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  37.82 
 
 
824 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.57 
 
 
818 aa  426  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  35.62 
 
 
829 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.5 
 
 
817 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  35.34 
 
 
846 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 
786 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  32.94 
 
 
839 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  33.61 
 
 
833 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
793 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 
785 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
897 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.92 
 
 
843 aa  389  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  32.58 
 
 
880 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  36.06 
 
 
843 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  35.37 
 
 
831 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  28.37 
 
 
847 aa  349  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  29.36 
 
 
940 aa  344  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.66 
 
 
837 aa  343  8e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  33.09 
 
 
838 aa  340  8e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  38.72 
 
 
663 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
763 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  26.47 
 
 
839 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  26.47 
 
 
839 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  26.47 
 
 
839 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  26.47 
 
 
839 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  26.47 
 
 
839 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  26.47 
 
 
839 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  26.35 
 
 
839 aa  190  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.41 
 
 
845 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  26.43 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.08 
 
 
882 aa  178  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  25.85 
 
 
882 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
1144 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
853 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 
816 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.61 
 
 
826 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  23.62 
 
 
962 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.32 
 
 
744 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  22.32 
 
 
821 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  24.25 
 
 
820 aa  158  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  23.56 
 
 
828 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  24.88 
 
 
827 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  23.56 
 
 
828 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  23.56 
 
 
828 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.97 
 
 
826 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  25.06 
 
 
812 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  24.06 
 
 
816 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.19 
 
 
984 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  24.59 
 
 
825 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  26.02 
 
 
856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  26.46 
 
 
811 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.31 
 
 
878 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 
724 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.63 
 
 
720 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.88 
 
 
971 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.81 
 
 
734 aa  121  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  24.73 
 
 
815 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.51 
 
 
1362 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.45 
 
 
906 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  20.84 
 
 
1270 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.76 
 
 
1033 aa  74.3  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.52 
 
 
640 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.06 
 
 
901 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.35 
 
 
799 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.41 
 
 
757 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.05 
 
 
972 aa  70.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.73 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  22.29 
 
 
1024 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.37 
 
 
1243 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.84 
 
 
884 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.38 
 
 
992 aa  61.6  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.17 
 
 
889 aa  61.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>