104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1074 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  100 
 
 		 815 aa  1612    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 853 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  35.89 
 
 		 882 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  35.63 
 
 		 839 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  35.63 
 
 		 839 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  35.63 
 
 		 839 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  35.63 
 
 		 839 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  35.63 
 
 		 839 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  35.63 
 
 		 839 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  35.5 
 
 		 839 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  34.67 
 
 		 882 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.7 
 
 		 826 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 		 816 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  34.97 
 
 		 839 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  30.63 
 
 		 821 aa  364  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  34.88 
 
 		 820 aa  361  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  35.29 
 
 		 816 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.81 
 
 		 826 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  34.42 
 
 		 856 aa  357  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  35.12 
 
 		 811 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  36.39 
 
 		 825 aa  356  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  35.29 
 
 		 812 aa  356  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  34.99 
 
 		 828 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  34.99 
 
 		 828 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  34.99 
 
 		 828 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  34.45 
 
 		 827 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  20.03 
 
 		 837 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.08 
 
 		 845 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  24.25 
 
 		 838 aa  127  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  27.3 
 
 		 833 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  21.99 
 
 		 847 aa  125  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  27.2 
 
 		 839 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  22.14 
 
 		 864 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  27.15 
 
 		 819 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  26.67 
 
 		 815 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  26.53 
 
 		 819 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  23.53 
 
 		 837 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.46 
 
 		 835 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  24.07 
 
 		 823 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  30.94 
 
 		 831 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  26.88 
 
 		 824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 897 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.28 
 
 		 813 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.12 
 
 		 845 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  26.76 
 
 		 840 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  23.04 
 
 		 813 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  24.15 
 
 		 802 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.56 
 
 		 819 aa  108  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.96 
 
 		 845 aa  106  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.38 
 
 		 843 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  23.71 
 
 		 802 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  25.04 
 
 		 891 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 891 aa  105  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  28.48 
 
 		 829 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  29.47 
 
 		 799 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  26.9 
 
 		 824 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  33.33 
 
 		 812 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.89 
 
 		 842 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  27.62 
 
 		 846 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 785 aa  101  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 871 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  25.42 
 
 		 860 aa  99  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 793 aa  96.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  28.08 
 
 		 880 aa  96.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.06 
 
 		 872 aa  95.1  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.72 
 
 		 818 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  23.15 
 
 		 861 aa  90.9  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 863 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.25 
 
 		 817 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  23.23 
 
 		 875 aa  84.3  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.37 
 
 		 843 aa  82.4  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  36.03 
 
 		 648 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.35 
 
 		 878 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  22.51 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  22.33 
 
 		 940 aa  65.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  24.63 
 
 		 962 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.73 
 
 		 984 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  21.62 
 
 		 1035 aa  58.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.23 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.52 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 734 aa  55.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 609 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  22.28 
 
 		 1108 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21.99 
 
 		 906 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.49 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 888 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 832 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.28 
 
 		 971 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 724 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.86 
 
 		 862 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.67 
 
 		 923 aa  48.5  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.33 
 
 		 794 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  25.78 
 
 		 598 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.34 
 
 		 1129 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.95 
 
 		 1243 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.92 
 
 		 1033 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.55 
 
 		 889 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 739 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>