137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0188 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  48.86 
 
 		 839 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  48.86 
 
 		 839 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  48.02 
 
 		 882 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  48.86 
 
 		 839 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  48.86 
 
 		 839 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  48.6 
 
 		 839 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  48.86 
 
 		 839 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  48.86 
 
 		 839 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  44.96 
 
 		 816 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  100 
 
 		 811 aa  1590    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  45.74 
 
 		 882 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.77 
 
 		 826 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  46.09 
 
 		 820 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.89 
 
 		 826 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  48.85 
 
 		 839 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  44.89 
 
 		 856 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 		 853 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  46.03 
 
 		 816 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  47.62 
 
 		 825 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  45.59 
 
 		 812 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  45.54 
 
 		 828 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  45.98 
 
 		 827 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  45.54 
 
 		 828 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  45.54 
 
 		 828 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  34.96 
 
 		 821 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  35.62 
 
 		 815 aa  350  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  23.15 
 
 		 837 aa  193  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  24.13 
 
 		 813 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  28.61 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  25.67 
 
 		 864 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.87 
 
 		 835 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 785 aa  172  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 793 aa  172  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  29.79 
 
 		 831 aa  170  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 786 aa  168  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  24.87 
 
 		 847 aa  167  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  24.82 
 
 		 815 aa  164  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  29.76 
 
 		 829 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 871 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.78 
 
 		 813 aa  154  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.25 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  26.61 
 
 		 833 aa  149  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 863 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.04 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.77 
 
 		 872 aa  144  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  28.92 
 
 		 824 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  27.76 
 
 		 840 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  25.87 
 
 		 819 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.07 
 
 		 845 aa  142  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  26.56 
 
 		 819 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  25.12 
 
 		 824 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.68 
 
 		 845 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 897 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  24.1 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  27.11 
 
 		 839 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  29.75 
 
 		 812 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  27.71 
 
 		 846 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.91 
 
 		 842 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  23.18 
 
 		 802 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.07 
 
 		 818 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  23.17 
 
 		 838 aa  133  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  25 
 
 		 860 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.12 
 
 		 845 aa  130  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  32.9 
 
 		 648 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  27.62 
 
 		 880 aa  127  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  23.83 
 
 		 837 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.32 
 
 		 843 aa  127  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 663 aa  124  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  26.23 
 
 		 891 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 891 aa  118  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  29.76 
 
 		 799 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  25.27 
 
 		 861 aa  115  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  24.58 
 
 		 962 aa  115  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.75 
 
 		 843 aa  114  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  25.63 
 
 		 875 aa  108  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 763 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 724 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 739 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.24 
 
 		 984 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.92 
 
 		 720 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.6 
 
 		 971 aa  84.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.51 
 
 		 940 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.6 
 
 		 734 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.69 
 
 		 906 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.61 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.65 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.85 
 
 		 1362 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  29.41 
 
 		 1003 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.76 
 
 		 992 aa  62  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.5 
 
 		 1018 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.6 
 
 		 1041 aa  58.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 1020 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.15 
 
 		 968 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  28.03 
 
 		 607 aa  55.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.12 
 
 		 602 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.53 
 
 		 609 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 		 986 aa  54.7  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.36 
 
 		 1243 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.89 
 
 		 1003 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.86 
 
 		 603 aa  52.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>