265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1167 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  53.13 
 
 
793 aa  848    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  93.12 
 
 
785 aa  1516    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.55 
 
 
813 aa  636    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
786 aa  1596    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  39.37 
 
 
813 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  36.49 
 
 
839 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  37.15 
 
 
833 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  36.19 
 
 
837 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.26 
 
 
835 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  35.88 
 
 
864 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  33.5 
 
 
823 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  36.49 
 
 
819 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  36.84 
 
 
846 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  36.68 
 
 
824 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  36.19 
 
 
891 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  36.35 
 
 
840 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.46 
 
 
845 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 
891 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  36.86 
 
 
812 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  34.83 
 
 
829 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.29 
 
 
845 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
871 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.59 
 
 
842 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.62 
 
 
817 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  33.03 
 
 
819 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  37.1 
 
 
860 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  34.07 
 
 
831 aa  399  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  33.63 
 
 
819 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.08 
 
 
818 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 
863 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  33.54 
 
 
875 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  34.14 
 
 
824 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  34.56 
 
 
815 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  34.92 
 
 
861 aa  385  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.4 
 
 
872 aa  386  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  37.74 
 
 
799 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.07 
 
 
843 aa  379  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  30.06 
 
 
880 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  36.25 
 
 
847 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  31.47 
 
 
802 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.74 
 
 
837 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  30.02 
 
 
802 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.71 
 
 
843 aa  357  5.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  32.49 
 
 
838 aa  306  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  37.91 
 
 
897 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  42.38 
 
 
663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
763 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  27.17 
 
 
845 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  24.67 
 
 
940 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.23 
 
 
826 aa  190  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.37 
 
 
826 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 
816 aa  184  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  24.96 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  24.88 
 
 
839 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  24.88 
 
 
839 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  24.88 
 
 
839 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  24.88 
 
 
839 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  24.88 
 
 
839 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  24.88 
 
 
839 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  24.73 
 
 
821 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.6 
 
 
744 aa  178  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  25 
 
 
839 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
734 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  24.78 
 
 
820 aa  167  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  24.53 
 
 
827 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  24.24 
 
 
816 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  24.41 
 
 
828 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  24.41 
 
 
828 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  24.41 
 
 
828 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  25.19 
 
 
811 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  24.38 
 
 
812 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  24.2 
 
 
825 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 
853 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  22.34 
 
 
882 aa  151  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
724 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  23.27 
 
 
882 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.62 
 
 
984 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.59 
 
 
720 aa  144  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
739 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.25 
 
 
878 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  24.18 
 
 
856 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.3 
 
 
971 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  21.92 
 
 
962 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 
1144 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  21.72 
 
 
815 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.64 
 
 
892 aa  98.2  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.26 
 
 
602 aa  89  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.47 
 
 
1362 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.76 
 
 
800 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.06 
 
 
905 aa  84.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.75 
 
 
619 aa  83.2  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.63 
 
 
575 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.83 
 
 
757 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  27.68 
 
 
1012 aa  82  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21.42 
 
 
906 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.01 
 
 
623 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  24.14 
 
 
815 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
951 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.36 
 
 
1018 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.11 
 
 
864 aa  75.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>