144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1576 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  100 
 
 		 839 aa  1697    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  54.35 
 
 		 819 aa  865    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  83.65 
 
 		 833 aa  1401    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  52.41 
 
 		 823 aa  886    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  41.83 
 
 		 837 aa  625  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  39.59 
 
 		 847 aa  614  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  38.55 
 
 		 813 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  37.93 
 
 		 838 aa  529  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  36.49 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  33.92 
 
 		 837 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.88 
 
 		 835 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 785 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.05 
 
 		 813 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  36.06 
 
 		 875 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  34.92 
 
 		 864 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.47 
 
 		 845 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 793 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.62 
 
 		 842 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.29 
 
 		 845 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  33.8 
 
 		 860 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.87 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 871 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  38.33 
 
 		 840 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.92 
 
 		 818 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 		 863 aa  406  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.43 
 
 		 872 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 897 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  36.08 
 
 		 861 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  38.24 
 
 		 824 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  33.45 
 
 		 891 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 891 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  37.55 
 
 		 846 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  36.22 
 
 		 812 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  33.66 
 
 		 815 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  36.55 
 
 		 829 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  34.66 
 
 		 819 aa  364  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  37.17 
 
 		 880 aa  363  5.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  33.78 
 
 		 819 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  39.66 
 
 		 799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  33.18 
 
 		 824 aa  357  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  36.66 
 
 		 831 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.52 
 
 		 843 aa  344  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.55 
 
 		 843 aa  340  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  30.48 
 
 		 802 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  29.09 
 
 		 802 aa  330  8e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  30.32 
 
 		 940 aa  273  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  38.61 
 
 		 663 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  26.37 
 
 		 845 aa  226  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  28.68 
 
 		 820 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 763 aa  198  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.77 
 
 		 878 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 816 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  28.11 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  28.11 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  28.11 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  28.11 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  28.11 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  28.11 
 
 		 839 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 		 826 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  28.24 
 
 		 839 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.09 
 
 		 826 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  28.37 
 
 		 839 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  25.15 
 
 		 821 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  26.18 
 
 		 962 aa  178  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.17 
 
 		 882 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  28.02 
 
 		 882 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 853 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  29.26 
 
 		 816 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.07 
 
 		 744 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  28.87 
 
 		 828 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  28.87 
 
 		 828 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  28.87 
 
 		 828 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 1144 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  28.75 
 
 		 812 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  27.22 
 
 		 827 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  27.37 
 
 		 856 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  27.39 
 
 		 811 aa  146  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  28.61 
 
 		 825 aa  145  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.41 
 
 		 971 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  23 
 
 		 984 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.35 
 
 		 720 aa  128  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.42 
 
 		 815 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 724 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 739 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.36 
 
 		 1362 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 906 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  21.2 
 
 		 1270 aa  68.2  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.78 
 
 		 1243 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  24.64 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.35 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  21.1 
 
 		 743 aa  64.7  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.11 
 
 		 858 aa  64.7  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  21.11 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.15 
 
 		 905 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.64 
 
 		 972 aa  58.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  22 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.08 
 
 		 859 aa  57.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.87 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>