176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0169 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  100 
 
 		 821 aa  1716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  40.03 
 
 		 882 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  38.57 
 
 		 882 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.74 
 
 		 826 aa  532  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 		 853 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  36.52 
 
 		 856 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.59 
 
 		 826 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  38.71 
 
 		 839 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  38.44 
 
 		 839 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  38.44 
 
 		 839 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  38.04 
 
 		 839 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  38.04 
 
 		 839 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  38.04 
 
 		 839 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  38.04 
 
 		 839 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 		 816 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  39.73 
 
 		 816 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  36.01 
 
 		 820 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  38.86 
 
 		 812 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  37.85 
 
 		 839 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  38.62 
 
 		 827 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  38.67 
 
 		 828 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  38.67 
 
 		 828 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  38.4 
 
 		 825 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  38.67 
 
 		 828 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  34.74 
 
 		 811 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  30.63 
 
 		 815 aa  348  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  25.03 
 
 		 813 aa  230  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.18 
 
 		 819 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  26.5 
 
 		 847 aa  198  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  22.62 
 
 		 837 aa  198  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  27.56 
 
 		 815 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  26.03 
 
 		 823 aa  191  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  27.36 
 
 		 838 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.69 
 
 		 813 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 793 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  27.23 
 
 		 819 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 786 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 785 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 		 871 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.84 
 
 		 835 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  23.27 
 
 		 837 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.66 
 
 		 872 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.02 
 
 		 864 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  25.93 
 
 		 833 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  26.48 
 
 		 824 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  26.46 
 
 		 819 aa  171  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.93 
 
 		 842 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  25.15 
 
 		 839 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  24.84 
 
 		 802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.76 
 
 		 845 aa  163  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  26.99 
 
 		 802 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 863 aa  160  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.32 
 
 		 845 aa  159  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  24.03 
 
 		 891 aa  156  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 897 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  23.01 
 
 		 880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  25.04 
 
 		 829 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 		 891 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  22.18 
 
 		 860 aa  154  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  23.73 
 
 		 831 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  24.29 
 
 		 824 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  22.94 
 
 		 840 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  23.47 
 
 		 812 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  22.14 
 
 		 845 aa  135  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  24.46 
 
 		 861 aa  132  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  23.08 
 
 		 846 aa  132  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.89 
 
 		 817 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.61 
 
 		 818 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 763 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  23.54 
 
 		 875 aa  127  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.34 
 
 		 843 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  24.1 
 
 		 799 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  22.84 
 
 		 940 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 663 aa  110  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.91 
 
 		 843 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.85 
 
 		 971 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  23.31 
 
 		 962 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.83 
 
 		 984 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  27.94 
 
 		 648 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  20.37 
 
 		 906 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.55 
 
 		 878 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.73 
 
 		 720 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.79 
 
 		 744 aa  83.2  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  20.03 
 
 		 734 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 		 1144 aa  78.2  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  19.17 
 
 		 724 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  19.95 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.29 
 
 		 1424 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.55 
 
 		 824 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  21.34 
 
 		 928 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 		 603 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  22.94 
 
 		 859 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  22.72 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  21.18 
 
 		 1015 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  22.05 
 
 		 807 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.09 
 
 		 602 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.35 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.84 
 
 		 1362 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.26 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 		 626 aa  57.4  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>