219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3078 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 609 aa  1192    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  54.79 
 
 		 624 aa  554  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.82 
 
 		 744 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 739 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 734 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.15 
 
 		 720 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  26.18 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  25 
 
 		 837 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.05 
 
 		 824 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  25.74 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.98 
 
 		 878 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.43 
 
 		 971 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  27.66 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 803 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.33 
 
 		 972 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.27 
 
 		 1041 aa  71.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.07 
 
 		 984 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  26.55 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  34.9 
 
 		 829 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  24.26 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  27.08 
 
 		 889 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  25.55 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.73 
 
 		 845 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  26.74 
 
 		 823 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  23.26 
 
 		 837 aa  68.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.48 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.07 
 
 		 903 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 825 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  24.71 
 
 		 819 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27 
 
 		 1781 aa  66.6  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.48 
 
 		 986 aa  65.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.15 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.45 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.46 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  35.46 
 
 		 840 aa  64.3  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 		 906 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  24.68 
 
 		 860 aa  64.3  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  22.37 
 
 		 813 aa  64.3  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  31.31 
 
 		 812 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.93 
 
 		 817 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  22.74 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  31.03 
 
 		 824 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  29.44 
 
 		 815 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.57 
 
 		 1063 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  31.85 
 
 		 962 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  24.62 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 853 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 655 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  25.63 
 
 		 875 aa  61.6  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.17 
 
 		 785 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27 
 
 		 940 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  24.63 
 
 		 964 aa  61.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  20.12 
 
 		 862 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.44 
 
 		 932 aa  60.8  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 		 1144 aa  60.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.35 
 
 		 757 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  22.66 
 
 		 928 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  21.28 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 984 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  21.87 
 
 		 743 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.2 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.1 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  21.53 
 
 		 1084 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  22.2 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 829 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.4 
 
 		 843 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  23.14 
 
 		 1045 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.94 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  33.77 
 
 		 831 aa  58.9  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  23.57 
 
 		 847 aa  58.9  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  22.22 
 
 		 1084 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 913 aa  58.5  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.1 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  25.77 
 
 		 846 aa  58.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  21.39 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  30.26 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  33.58 
 
 		 856 aa  57.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.03 
 
 		 922 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.43 
 
 		 892 aa  57.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  24.66 
 
 		 891 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  22.57 
 
 		 1015 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  27.67 
 
 		 838 aa  57.4  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 891 aa  57  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.23 
 
 		 614 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.75 
 
 		 1033 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 919 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 873 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.17 
 
 		 1019 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.75 
 
 		 826 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  21.68 
 
 		 781 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  24.93 
 
 		 1024 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  21.86 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.63 
 
 		 1013 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>