209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3722 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  55.15 
 
 
799 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  51.61 
 
 
846 aa  788    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  52.69 
 
 
840 aa  803    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  48.17 
 
 
817 aa  762    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  44.88 
 
 
880 aa  709    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  48.78 
 
 
818 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  48.56 
 
 
843 aa  706    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  53.24 
 
 
831 aa  800    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  49.3 
 
 
843 aa  714    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  54.71 
 
 
824 aa  848    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  100 
 
 
829 aa  1657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  55.53 
 
 
812 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  32.88 
 
 
813 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.34 
 
 
813 aa  429  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.62 
 
 
845 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  33.46 
 
 
864 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 
786 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
785 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 
793 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 
863 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  36.47 
 
 
819 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
871 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.2 
 
 
845 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.41 
 
 
872 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  31.35 
 
 
860 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.49 
 
 
842 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  34.14 
 
 
819 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  37.45 
 
 
833 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  31.28 
 
 
891 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 
891 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  30.82 
 
 
802 aa  360  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  34.25 
 
 
819 aa  360  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  33.97 
 
 
823 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  36.55 
 
 
839 aa  357  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  32.86 
 
 
875 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 
897 aa  353  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  29.7 
 
 
837 aa  352  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.34 
 
 
835 aa  351  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  31.67 
 
 
861 aa  345  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  34.33 
 
 
824 aa  344  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  30.38 
 
 
802 aa  344  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  32.8 
 
 
815 aa  336  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  33.55 
 
 
838 aa  322  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.37 
 
 
837 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  31.53 
 
 
847 aa  300  9e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  29.02 
 
 
940 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  29.6 
 
 
845 aa  227  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  34.41 
 
 
663 aa  220  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  30.75 
 
 
839 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  30.75 
 
 
839 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  30.75 
 
 
839 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  30.75 
 
 
839 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  30.75 
 
 
839 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  30.75 
 
 
839 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  30.52 
 
 
839 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  30.75 
 
 
839 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  30.48 
 
 
882 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.87 
 
 
826 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.73 
 
 
882 aa  187  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.59 
 
 
826 aa  187  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 
816 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  29.51 
 
 
816 aa  171  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  28.38 
 
 
828 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  28.38 
 
 
828 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  28.38 
 
 
828 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  29.1 
 
 
820 aa  164  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  29.03 
 
 
825 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  29.85 
 
 
827 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  28.85 
 
 
856 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  25.04 
 
 
821 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  29.76 
 
 
811 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  28.34 
 
 
812 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
853 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.27 
 
 
720 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  24.7 
 
 
962 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 
1144 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.1 
 
 
878 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.81 
 
 
971 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.26 
 
 
744 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 
734 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.48 
 
 
815 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
739 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.77 
 
 
984 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 
724 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  26.89 
 
 
889 aa  78.2  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 
906 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.8 
 
 
992 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.58 
 
 
972 aa  75.5  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.9 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.68 
 
 
923 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 
951 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  29.13 
 
 
1024 aa  68.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.42 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.16 
 
 
1041 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.7 
 
 
1362 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.32 
 
 
892 aa  65.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.4 
 
 
1033 aa  65.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  28.09 
 
 
1003 aa  64.7  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  22.05 
 
 
743 aa  63.9  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>