146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0652 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  99.76 
 
 
839 aa  1671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  49.22 
 
 
853 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  99.76 
 
 
839 aa  1673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  60.92 
 
 
816 aa  959    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  91.42 
 
 
839 aa  1507    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  53.25 
 
 
882 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  48.4 
 
 
856 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  62.44 
 
 
828 aa  946    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  60.02 
 
 
827 aa  940    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  62.44 
 
 
828 aa  946    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  99.76 
 
 
839 aa  1671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  99.76 
 
 
839 aa  1671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  99.17 
 
 
839 aa  1663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
839 aa  1676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  99.76 
 
 
839 aa  1671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
816 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  61.31 
 
 
825 aa  939    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  48.35 
 
 
811 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  62.44 
 
 
828 aa  946    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  60.64 
 
 
812 aa  934    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  53.58 
 
 
882 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  48.13 
 
 
826 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  47.46 
 
 
820 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.4 
 
 
826 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  38.44 
 
 
821 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  35.41 
 
 
815 aa  358  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  30.5 
 
 
819 aa  213  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  24.58 
 
 
837 aa  206  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  30.75 
 
 
829 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.47 
 
 
845 aa  191  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.26 
 
 
835 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.14 
 
 
813 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  39.4 
 
 
648 aa  184  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  28.38 
 
 
823 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 
785 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  25.17 
 
 
847 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 
786 aa  179  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  27.86 
 
 
839 aa  177  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  25.21 
 
 
864 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  30.86 
 
 
833 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.84 
 
 
845 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  27.45 
 
 
837 aa  171  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 
871 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  26.68 
 
 
838 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  23.88 
 
 
813 aa  163  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  26.88 
 
 
815 aa  162  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  26.77 
 
 
891 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
891 aa  154  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
897 aa  154  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  27.41 
 
 
824 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  28.76 
 
 
802 aa  154  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 
793 aa  153  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  25.14 
 
 
845 aa  153  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  26.91 
 
 
802 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.3 
 
 
842 aa  152  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  28.24 
 
 
875 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  26.61 
 
 
860 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  27.24 
 
 
880 aa  149  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.55 
 
 
818 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.71 
 
 
817 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  28.85 
 
 
824 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.21 
 
 
872 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  26.46 
 
 
819 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  26.9 
 
 
819 aa  144  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  26.24 
 
 
861 aa  141  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  28.92 
 
 
840 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
863 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
663 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  30.29 
 
 
799 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  27.8 
 
 
846 aa  138  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  29.18 
 
 
831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.79 
 
 
843 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.84 
 
 
843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.17 
 
 
962 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
763 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  29.06 
 
 
812 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.6 
 
 
940 aa  92.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.47 
 
 
984 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 
734 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 
724 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.76 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.82 
 
 
971 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.3 
 
 
878 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  22.93 
 
 
739 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.44 
 
 
720 aa  71.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  27.27 
 
 
964 aa  71.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  31.82 
 
 
613 aa  61.2  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.98 
 
 
929 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.61 
 
 
996 aa  58.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.61 
 
 
602 aa  57.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  25 
 
 
597 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21.3 
 
 
906 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.31 
 
 
1362 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  29.3 
 
 
603 aa  55.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  28.34 
 
 
1003 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 
813 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  26.5 
 
 
992 aa  54.3  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  35.61 
 
 
625 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  31.88 
 
 
607 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  23.86 
 
 
862 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>