125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4156 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  60.87 
 
 		 839 aa  974    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  49.39 
 
 		 853 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  60.99 
 
 		 839 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  90.45 
 
 		 816 aa  1464    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  62.24 
 
 		 839 aa  956    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  52.76 
 
 		 882 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  50.54 
 
 		 856 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  100 
 
 		 828 aa  1647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  85.92 
 
 		 827 aa  1378    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  100 
 
 		 828 aa  1647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  60.87 
 
 		 839 aa  974    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  60.87 
 
 		 839 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  61.23 
 
 		 839 aa  978    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  60.87 
 
 		 839 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  60.87 
 
 		 839 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  47.15 
 
 		 816 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  83.94 
 
 		 825 aa  1325    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  100 
 
 		 828 aa  1647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  86.1 
 
 		 812 aa  1362    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  52.75 
 
 		 882 aa  807    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  49.03 
 
 		 826 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  45.95 
 
 		 820 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  48.78 
 
 		 826 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  45.79 
 
 		 811 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  39.07 
 
 		 821 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  35.23 
 
 		 815 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  24.88 
 
 		 837 aa  208  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  29.19 
 
 		 823 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.04 
 
 		 835 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.39 
 
 		 842 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.72 
 
 		 819 aa  180  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  24.93 
 
 		 813 aa  173  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  38.28 
 
 		 648 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  28.68 
 
 		 829 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.9 
 
 		 813 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  25.54 
 
 		 847 aa  165  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 786 aa  165  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 785 aa  165  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.79 
 
 		 864 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  27.33 
 
 		 837 aa  164  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  27.47 
 
 		 875 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  27.94 
 
 		 815 aa  161  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  27.63 
 
 		 861 aa  160  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.56 
 
 		 845 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  28.32 
 
 		 839 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  27.2 
 
 		 891 aa  158  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.86 
 
 		 845 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 863 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 891 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  28.34 
 
 		 833 aa  152  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  24.25 
 
 		 838 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 871 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  28.96 
 
 		 824 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  29.45 
 
 		 819 aa  148  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  28.45 
 
 		 819 aa  148  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.85 
 
 		 845 aa  140  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  27.09 
 
 		 840 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.57 
 
 		 818 aa  137  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.93 
 
 		 817 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  22.59 
 
 		 793 aa  135  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  25.44 
 
 		 860 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  26.43 
 
 		 802 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  29.12 
 
 		 812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.57 
 
 		 872 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 897 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  28.4 
 
 		 824 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  25.17 
 
 		 802 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  28.01 
 
 		 831 aa  125  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.08 
 
 		 843 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.11 
 
 		 843 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 663 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  27.72 
 
 		 799 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  26.4 
 
 		 846 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  26.41 
 
 		 880 aa  108  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 763 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.59 
 
 		 744 aa  92.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  22.62 
 
 		 940 aa  92  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.67 
 
 		 720 aa  87.8  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  23.02 
 
 		 962 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.62 
 
 		 984 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.04 
 
 		 724 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.13 
 
 		 971 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  26.76 
 
 		 964 aa  70.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 734 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.63 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  32.59 
 
 		 584 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 626 aa  55.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.94 
 
 		 837 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.86 
 
 		 1064 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.23 
 
 		 1362 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.61 
 
 		 1041 aa  54.3  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.86 
 
 		 619 aa  53.9  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.96 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 945 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.73 
 
 		 972 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.79 
 
 		 621 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.96 
 
 		 609 aa  52.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.44 
 
 		 882 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 829 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>