137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2713 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
663 aa  1372    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 
871 aa  340  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.35 
 
 
842 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  43.06 
 
 
863 aa  316  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  42.82 
 
 
861 aa  302  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  44.35 
 
 
864 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  41.18 
 
 
813 aa  280  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.03 
 
 
872 aa  277  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  42.36 
 
 
860 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  42.38 
 
 
786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  39.28 
 
 
875 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  41 
 
 
785 aa  266  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.94 
 
 
813 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  40.34 
 
 
891 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 
891 aa  259  9e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  38.98 
 
 
839 aa  251  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.85 
 
 
845 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  39.34 
 
 
793 aa  247  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  37.5 
 
 
819 aa  246  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  40.06 
 
 
819 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  38.72 
 
 
845 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  40.12 
 
 
815 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  38.33 
 
 
833 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 
897 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  39.77 
 
 
819 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  39.3 
 
 
824 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  37.98 
 
 
838 aa  237  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  35.82 
 
 
823 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  35.88 
 
 
802 aa  227  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  36.41 
 
 
802 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  32.69 
 
 
847 aa  225  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  34.41 
 
 
829 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  34.95 
 
 
846 aa  220  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  35.37 
 
 
824 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.14 
 
 
843 aa  216  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  32.01 
 
 
880 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.03 
 
 
818 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  33.96 
 
 
837 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.77 
 
 
817 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.98 
 
 
835 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  36.83 
 
 
840 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  33.43 
 
 
831 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  37.43 
 
 
799 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  35.98 
 
 
837 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.89 
 
 
843 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  32.38 
 
 
812 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.42 
 
 
940 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 
816 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.3 
 
 
882 aa  142  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  27.99 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  27.3 
 
 
882 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  27.99 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  27.99 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  27.99 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  27.99 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  27.99 
 
 
839 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  27.99 
 
 
839 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.84 
 
 
826 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  29.75 
 
 
845 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.84 
 
 
826 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.97 
 
 
744 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  27.48 
 
 
839 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
763 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  27.45 
 
 
811 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  26.54 
 
 
816 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  26.04 
 
 
812 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  25.63 
 
 
856 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  26.32 
 
 
828 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  26.32 
 
 
828 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  26.32 
 
 
828 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  26.59 
 
 
825 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  25.76 
 
 
827 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  25.14 
 
 
820 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
853 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  27.46 
 
 
821 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 
878 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.93 
 
 
962 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.34 
 
 
984 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
739 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 
724 aa  94  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.65 
 
 
720 aa  90.9  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.97 
 
 
971 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
1144 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 
734 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  22.51 
 
 
815 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.3 
 
 
1362 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.21 
 
 
992 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.96 
 
 
1003 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.99 
 
 
992 aa  57.4  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  28.99 
 
 
1046 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  30.14 
 
 
1035 aa  55.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  27.66 
 
 
1108 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.96 
 
 
808 aa  53.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  31.06 
 
 
1012 aa  52.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  23.21 
 
 
1024 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.67 
 
 
858 aa  51.6  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.64 
 
 
1026 aa  51.6  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.34 
 
 
1033 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  26.79 
 
 
1020 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21.71 
 
 
906 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>