64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1270 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  100 
 
 
753 aa  1498    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  65.92 
 
 
622 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  88.86 
 
 
788 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  72.12 
 
 
884 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  92.91 
 
 
710 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  64.05 
 
 
504 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  59.26 
 
 
918 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  46.03 
 
 
586 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  67.6 
 
 
672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  57.69 
 
 
663 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  44.92 
 
 
1243 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  64.04 
 
 
1148 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  48.09 
 
 
691 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  57.14 
 
 
494 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  55.37 
 
 
3244 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  53.33 
 
 
2079 aa  127  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.95 
 
 
651 aa  117  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  52.26 
 
 
824 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  39.46 
 
 
641 aa  107  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.83 
 
 
674 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  45.81 
 
 
1779 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.82 
 
 
583 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.21 
 
 
815 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  58.06 
 
 
726 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  65.22 
 
 
1016 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.26 
 
 
474 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  56.76 
 
 
688 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  49.53 
 
 
840 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  35.86 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.67 
 
 
962 aa  84  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.96 
 
 
1072 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  33.14 
 
 
2402 aa  81.3  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  36.43 
 
 
778 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.57 
 
 
933 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  45 
 
 
592 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  70.67 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  32.55 
 
 
2271 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  32.55 
 
 
2271 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.37 
 
 
1321 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  40.37 
 
 
1338 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.12 
 
 
605 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  40.97 
 
 
1672 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  43.26 
 
 
1879 aa  58.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.58 
 
 
597 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
1222 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.16 
 
 
1673 aa  57.4  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  29.61 
 
 
1870 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  36.97 
 
 
2853 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.22 
 
 
887 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  37.14 
 
 
919 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  33.54 
 
 
731 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.57 
 
 
3563 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.17 
 
 
692 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.16 
 
 
11716 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  36.97 
 
 
2820 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  37.93 
 
 
1232 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  50 
 
 
1991 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  27.56 
 
 
1002 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.86 
 
 
1597 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  36.54 
 
 
2802 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.02 
 
 
3544 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34 
 
 
3542 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  37.31 
 
 
2636 aa  45.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  48.84 
 
 
1025 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>