17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0779 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0779  Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier  100 
 
 
760 aa  1536    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0583  hypothetical protein  45.01 
 
 
517 aa  303  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0607  hypothetical protein  43.04 
 
 
515 aa  295  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000138147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0724  hypothetical protein  43 
 
 
515 aa  293  9e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0728802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0602  hypothetical protein  43.62 
 
 
515 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0603  hypothetical protein  43.62 
 
 
515 aa  292  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000260984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4611  hypothetical protein  43 
 
 
515 aa  292  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000359693  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0761  hypothetical protein  43.22 
 
 
515 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0658  hypothetical protein  43.22 
 
 
515 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000101222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0692  hypothetical protein  43.22 
 
 
515 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0820  hypothetical protein  42.97 
 
 
515 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0747  hypothetical protein  43.48 
 
 
515 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000294502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2287  hypothetical protein  40.87 
 
 
516 aa  276  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000434113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0130  hypothetical protein  40.26 
 
 
514 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0135  hypothetical protein  40.26 
 
 
514 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.396927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1008  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.92 
 
 
519 aa  96.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  28.98 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>