147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0573 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  100 
 
 
1084 aa  2178    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  30.61 
 
 
971 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0496  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  22.74 
 
 
765 aa  70.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  36.67 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  35.64 
 
 
967 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  30.61 
 
 
971 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  30.61 
 
 
971 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.59 
 
 
816 aa  67  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  43.53 
 
 
712 aa  67  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  30.61 
 
 
971 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  30.61 
 
 
971 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  29.93 
 
 
971 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  32.69 
 
 
965 aa  65.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  31.97 
 
 
971 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  41.18 
 
 
814 aa  65.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  32.46 
 
 
948 aa  65.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  32.61 
 
 
1057 aa  65.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  33.65 
 
 
780 aa  65.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  34.31 
 
 
965 aa  65.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  30.61 
 
 
971 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  31.29 
 
 
971 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  40 
 
 
861 aa  65.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  36.46 
 
 
873 aa  65.1  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  29.93 
 
 
1018 aa  64.7  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  37.8 
 
 
623 aa  64.7  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  33.33 
 
 
965 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  34.38 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  34.38 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  40.23 
 
 
2066 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.58 
 
 
1916 aa  63.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  34.38 
 
 
965 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.56 
 
 
1565 aa  63.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  39.53 
 
 
734 aa  63.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  34.38 
 
 
965 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  36.27 
 
 
778 aa  62  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  32.35 
 
 
965 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.13 
 
 
1441 aa  61.6  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  36.36 
 
 
778 aa  61.6  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  44.78 
 
 
943 aa  61.6  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  36.36 
 
 
778 aa  61.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  36.36 
 
 
778 aa  61.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  32.35 
 
 
965 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  48.81 
 
 
792 aa  60.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32.08 
 
 
677 aa  61.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  45.68 
 
 
1601 aa  61.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  44.12 
 
 
884 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  40.48 
 
 
1150 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  34.23 
 
 
775 aa  60.1  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.16 
 
 
944 aa  60.1  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  32.35 
 
 
965 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  32.46 
 
 
948 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  29 
 
 
713 aa  60.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  39.58 
 
 
1104 aa  58.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  39.58 
 
 
1104 aa  58.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  36.26 
 
 
820 aa  58.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  31.58 
 
 
948 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.79 
 
 
942 aa  57.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  31.18 
 
 
777 aa  57.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  31.09 
 
 
945 aa  57  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  32.97 
 
 
944 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 
1158 aa  56.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  32.97 
 
 
944 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  32.98 
 
 
960 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0575  hypothetical protein  28.08 
 
 
443 aa  55.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.858406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.75 
 
 
386 aa  55.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  32.98 
 
 
960 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  32.97 
 
 
944 aa  56.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.63 
 
 
892 aa  55.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  42.53 
 
 
1081 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  31.87 
 
 
944 aa  54.7  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.63 
 
 
940 aa  55.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  36.71 
 
 
1162 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  31.91 
 
 
960 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.98 
 
 
1606 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  28.92 
 
 
1710 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  30.7 
 
 
948 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  40.7 
 
 
541 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.19 
 
 
6885 aa  53.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.86 
 
 
945 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 
601 aa  52.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  35.05 
 
 
1050 aa  52.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 
699 aa  52.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 
596 aa  52  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
639 aa  52  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  36.59 
 
 
552 aa  52  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.41 
 
 
735 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  44.44 
 
 
1367 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  30.18 
 
 
840 aa  51.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.05 
 
 
3197 aa  51.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  33.05 
 
 
3197 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  60.53 
 
 
871 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  39.74 
 
 
317 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  34.94 
 
 
1027 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  60.53 
 
 
865 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.08 
 
 
953 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  35.05 
 
 
575 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  30.49 
 
 
669 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2607  PKD  52 
 
 
235 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  34.85 
 
 
517 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  34.52 
 
 
938 aa  49.3  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>