19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1554 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  766    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 1710 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.54 
 
 		 1949 aa  295  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.77 
 
 		 2254 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0365  phosphotransferase domain-containing protein  36.89 
 
 		 776 aa  212  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0985561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0319  phosphotransferase domain-containing protein  33.23 
 
 		 546 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.888377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0337  phosphotransferase domain-containing protein  33.13 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  34.15 
 
 		 742 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  29.3 
 
 		 1855 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  28.49 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  27.98 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2748  hypothetical protein  27.14 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  24.73 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0708  hypothetical protein  23.2 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  24.25 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  23.32 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4702  hypothetical protein  21.73 
 
 		 751 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1123  hypothetical protein  22.75 
 
 		 786 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  30.5 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>