26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0025 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0365  phosphotransferase domain-containing protein  45.15 
 
 		 776 aa  649    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0985561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 742 aa  1498    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0319  phosphotransferase domain-containing protein  56.98 
 
 		 546 aa  608  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.888377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0337  phosphotransferase domain-containing protein  56.6 
 
 		 546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 1710 aa  172  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 377 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.55 
 
 		 1949 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30 
 
 		 2254 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  29.18 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  30.4 
 
 		 333 aa  118  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  29.21 
 
 		 1855 aa  114  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2748  hypothetical protein  26.82 
 
 		 429 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  30.95 
 
 		 462 aa  53.9  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  24.51 
 
 		 407 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1167  hypothetical protein  37.35 
 
 		 439 aa  52.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.018342 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1006  hypothetical protein  36.14 
 
 		 425 aa  52.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260042  hitchhiker  0.0010639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3024  phosphotransferase domain-containing protein  25.66 
 
 		 331 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.951388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  23.08 
 
 		 458 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  22.3 
 
 		 486 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  27.13 
 
 		 460 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0074  hypothetical protein  34.57 
 
 		 425 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.861381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2450  hypothetical protein  23.84 
 
 		 791 aa  47.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.256845 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0249  hypothetical protein  35.06 
 
 		 447 aa  47.8  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.463551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3026  phosphotransferase domain-containing protein  27.38 
 
 		 329 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1090  hypothetical protein  25.54 
 
 		 358 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.464508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  23.98 
 
 		 498 aa  45.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>